galvenā atšķirība starp VNTR un zondi ir tas VNTR ir īsa nukleotīdu secība, kas notiek kā tandēma atkārtojums genomā, kamēr zonde ir mākslīgi sintezēta īsa DNS vai RNS secība, ko varētu radioaktīvi iezīmēt..
VNTR nozīmē mainīga skaita tandēma atkārtojumu. Tā ir īsa nukleotīdu secība, kas organizēta tandēmā atkārtojas genomā. VNTR dabiski rodas mūsu genomā. Zonde ir mākslīgi sintezēta īsa DNS vai RNS secība. Gan zonde, gan VNTR ir nukleīnskābes vai īsas nukleotīdu sekvences. Viņiem ir milzīgs pielietojums dažādās molekulārbioloģiskajās metodēs, galvenokārt kriminālistikas pētījumos. VNTR un zondei ir dažas līdzības, kā arī atšķirības. Tādējādi rakstā mēģināts izcelt atšķirību starp VNTR un zondi.
1. Pārskats un galvenās atšķirības
2. Kas ir VNTR
3. Kas ir zonde
4. Līdzības starp VNTR un zondi
5. Salīdzinājums blakus - VNTR vs zonde tabulas formā
6. Kopsavilkums
VNTR ir īsa nukleotīdu secība, kas pastāv kā tandēma atkārtojums mūsu genomā. VNTR atrodas daudzās hromosomās. Turklāt VNTR dažādiem indivīdiem atšķiras no garuma, jo atkārtojumu skaits dažādu cilvēku VNTR ir atšķirīgs. Būtībā tas ir saistīts ar alēvēm, kas mantotas no vecākiem. Tāpēc VNTR galvenokārt izmantojam vecāku identificēšanai (mantošanai) vai personīgiem mērķiem. Līdzīgi tos ir iespējams izmantot arī ģenētikā, kriminālistikā, bioloģiskajā izpētē un DNS pirkstu nospiedumu ņemšanā. Tāpēc VNTR ir svarīgs rīks molekulārajā bioloģijā.
01. attēls: VNTR
Mantojumā mēs analizējam VNTR datus, izmantojot divus pamatprincipus: mantojuma saskaņošana un identitātes saskaņošana. Mantojuma sakritības laikā indivīdam jābūt atbilstošai alēlei ar katra vecāka alēli. Identitātes saskaņošanas laikā abām VNTR alēlēm jāatrodas noteiktā genoma vietā.
Molekulārās bioloģijas kontekstā zonde ir mākslīgi sintezēts DNS vai RNS fragments ar garumu no 100 līdz 1000 bāzēm. Mēs varam radioaktīvi marķēt šīs zondes. Tāpēc mēs tos izmantojam mērķa nukleotīdu secību noteikšanai, kas ir komplementāri zondes secībai. Kad paraugam pievienojam zondes, hibridizācija notiek ar komplementārām sekvencēm vai mērķa sekvencēm, un mums ir viegli identificēt mērķa sekvences. Tā kā zondes veic radioaktivitāti, mēs tās varam viegli noteikt.
02 attēls: zonde
Kriminālistikā mēs parasti izmantojam zondes DNS profilēšanas metodēs, piemēram, īsu tandēma atkārtotu reģionu noteikšanā, restrikcijas fragmenta garuma polimorfismos un DNS pirkstu nospiedumu noteikšanā..
VNTR ir genoma reģions, kas organizēts kā tandēma atkārtošanās, kamēr zonde ir īsa DNS vai RNS sekvence, kas sintezēta mākslīgi, lai paraugā noteiktu mērķa sekvences. Tātad, šī ir galvenā atšķirība starp VNTR un zondi. Svarīga atšķirība starp VNTR un zondi ir arī tā, ka atšķirībā no VNTR mēs varam radioaktīvi marķēt zondes.
Turklāt VNTR galvenokārt veic vecāku identifikāciju, kamēr zondes palīdz noteikt mērķa nukleotīdu secības DNS vai RNS paraugos, kas papildina zondes secību. Tādējādi šī ir arī būtiska atšķirība starp VNTR un zondi.
Šajā infografikā ir vairāk informācijas par atšķirību starp VNTR un zondi.
VNTR un zondi parasti izmanto molekulārās analīzes metodēs, piemēram, kriminālistikas pētījumos un DNS pirkstu nospiedumu ņemšanā. Abi sastāv no mainīga garuma. Tomēr galvenā atšķirība starp VNTR un zondi ir tāda, ka VNTR ir genoma reģions, kas sakārtots ar tandēma atkārtojumiem, kamēr zonde ir DNS vai RNS fragments, kuru varētu radioaktīvi iezīmēt. Turklāt VNTR ir sastopami genomā. Zondes tiek mākslīgi sintezētas, un tās var radioaktīvi marķēt, lai noteiktu mērķa nukleotīdu secības DNS vai RNS paraugos, kas papildina zondes secību. Tādējādi šis ir kopsavilkums par atšķirību starp VNTR un zondi.
1. “Mainīgs skaits tandēma atkārtojumu (VNTR) un tā pielietojums baktēriju epidemioloģijā.” Brīdinājums par zinātni: Vēstnesis, pieejams šeit.
2. “DNS zonde”. Dabas ziņas, Dabas izdevēju grupa, pieejama šeit.
1. PaleWhaleGail “D1S80Demo” angļu valodas Vikipēdijā (CC BY-SA 3.0), izmantojot Commons Wikimedia
2. “Molecular Beacons” (CC BY-SA 3.0), izmantojot Commons Wikimedia