Atšķirība starp kosmīdu un fagemīdu

galvenā atšķirība starp Kosmīdu un Phagemīdu atrodas tajā esošo secību tipā. Cosmid satur cos vietu un plazmīdu. Tāpēc tas ir hibrīds vektors, kamēr fagemīds ir plazmīda, kas satur F1 fāga replikācijas sākumu F1.

Kosmīdi un fagemiīdi tiek izmantoti klonēšanas nolūkos, jo īpaši, lai klonētu lielākus DNS fragmentus. Tos plaši izmanto, īpaši klonēšanas gēnos, kas ir atbildīgi par dažādu olbaltumvielu ražošanu. Kosmīdi un fagemiīdi tiek replicēti atsevišķi kā plazmīdas vai arī iesaiņoti vīrusu daļiņās un pēc tam replicēti.

SATURS

1. Pārskats un galvenās atšķirības
2. Kas ir kosmīds
3. Kas ir fagezīds
4. Līdzības starp Kosmidu un Fagemīdu
5. Salīdzinājums blakus - Cosmid vs Phagemid tabulas formā
6. Kopsavilkums

Kas ir kosmīds?

Kosmīds, ko sauc par hibrīdu plazmīdu, satur cos vietas, kas ekstrahētas no Lambda fāgu daļiņām, un plazmīdu. Šīs cos vietas ir gari DNS fragmenti ar 200 bāzes pāriem. Līdz ar to tiem ir saliedēti vai lipīgi gali, kas ļauj plazmīdai iekļauties vīrusa DNS. Tādēļ cos vietas ir vitāli svarīgas DNS iesaiņošanai.

Ir trīs cos vietnes;

• cosN vietne - iesaistīta DNS šķipsnas niķēšanā ar termāzes aktivitāti
• vietne cosB - nodarbojas ar termināzes turēšanu.
• cosQ vietne - iesaistīta DNS noārdīšanās novēršanā no DNāzēm.

01. attēls: Kosmīds

Arī kosmīdi var replicēt vienpavedienu DNS vai divpavedienu DNS, izmantojot piemērotu replikācijas sākumu. Kosmīdi parasti satur antibiotiku rezistences gēnus kā marķierus transformantu izvēlei. Tādējādi kosmīda kā vektora izmantošana var atvieglot klonēšanu, un vektora šķelšana ar restrikcijas enzīma palīdzību pēc tam var iegūt šos fragmentus.

Kas ir fagezīds (Phasmid)?

Phagemid, ko sauc arī par Phasmid, ir arī hibrīda vektora tips. Fagemidīds satur īpašu replikācijas sākumu, ko sauc par f1 replikācijas sākumu. F1 replikācijas izcelsmes izraksts tiek iegūts no f1 fāgas.

Fagemidīds var replicēt gan vienpavedienu, gan divpavedienu DNS. Replikācija var notikt vai nu kā plazmīda, vienlaikus veicot neatkarīgu replikāciju, vai arī tā var tikt iesaiņota fāgu daļiņās un beidzot inficēt baktēriju saimnieku E coli. Inficējot E coli šūnām, f1 fāgam nepieciešama pilusa klātbūtne. Tādējādi seksa pili ir svarīgi laikā in vitro Phagemīdu iepakojums.

Kādas ir līdzības starp Kosmidu un Phagemīdu?

• Gan Cosmid, gan Phagemid ir klonēšanas vektori, ko izmanto rekombinantās DNS tehnoloģijā.
• Kosmīds un Phagemid var replicēt vienpavedienu un divpavedienu DNS.
• Abas var veikt neatkarīgu replikāciju, līdzīgi kā plazmidām.
• Kosmid un Phagemid var tikt pakļauti in vitro iesaiņo un inficē baktēriju šūnas.
• Gan Cosmid, gan Phagemid klonēšanai nepieciešama piemērota replikācijas izcelsme.

Kāda ir atšķirība starp kosmīdu un fagemīdu?

Kosmids pret Phagemīdu
Kosmīds ir hibrīds vektors, kas satur cos vietu un plazmīdu.	Fagemidīds ir plazmīda, kas satur F1 fāga replikācijas sākumu F1.
Cos vietņu klātbūtne
Kos vietas atrodas kosmidā un ir vajadzīgas iesaiņošanai in vitro.	Che vietas fagemidī nav.
F1 replikācijas izcelsmes klātbūtne
Kosmidā fi lmas replikācijas izcelsme var būt vai nebūt.	F1 replikācijas sākums atrodas fagemidī.
Antibiotiku rezistentu gēnu klātbūtne
Antibiotiku rezistenti gēni atrodas kosmīdos, lai identificētu transformantus no ne-transformantiem.	Phagemīdos nav rezistentu pret antibiotikām gēnu.
Prasība iesaiņojumam in Vitro
Nepieciešama cos vietne.	Nepieciešama seksa balss.

Kopsavilkums - Kosmids vs Phagemid

Kosmīds un Phagemid ir klonēšanas vektori, ko izmanto rekombinantās DNS tehnoloģijā. Kosmīdi ir hibrīdi vektori, kas satur īpašus lipīgus galus, kas pazīstami kā cos vietas. in vitro iesaiņojums prasa šīs cos vietnes. Kaut arī fagemiīdi ir plazmīdas, kas satur f1 replikācijas sākumu, kas iegūts no f1 fāga. Gan kosmīdā, gan fagemīdā var veikt neatkarīgu replikāciju vai in vitro iesaiņošana baktēriju šūnās. Šīs ir svarīgās atšķirības starp kosmīdu un fagemīdu.

Atsauce:

1.Qi, H, et al. “Phagemid vektori fāgu attēlošanai: īpašības, raksturojums un uzbūve.” Journal of Molecular Biology., ASV Nacionālā medicīnas bibliotēka, 2012. gada 30. marts. Pieejams šeit 
2.Kollins, J un B Hohns. “Kosmīdi: plazmīdu gēnu klonēšanas vektora tips, ko var iesaiņot in vitro bakteriofāgu lambdu galvās.” Amerikas Savienoto Valstu Nacionālās zinātņu akadēmijas materiāli, ASV Nacionālā medicīnas bibliotēka, 1978. gada septembris. Pieejami šeit  

Attēla pieklājība:

1.'Cosmid (English) 'Autors Zlir'a (CC0), izmantojot Commons Wikimedia