Atšķirība starp DNS ligāzi un DNS polimerāzi

Galvenā atšķirība - DNS ligase vs DNS polimerāze
 

DNS līze un DNS polimerāze ir svarīgi fermenti, kas iesaistīti organismu DNS replikācijā un DNS atjaunošanas mehānismos. DNS ligase ir atbildīga par DNS fragmentu savienošanu, katalizējot fosfodiesteru saišu veidošanos starp nukleotīdiem. DNS polimerāze ir atbildīga par DNS sintēzi no tās celtniecības blokiem (nukleotīdiem), izmantojot matricas DNS. Šī ir galvenā atšķirība starp DNS ligatūru un DNS polimerāzi.

SATURS
1. Pārskats un galvenās atšķirības
2. Kas ir DNS ligase
3. Kas ir DNS polimerāze
4. Salīdzinājums blakus - DNS liga un DNS polimerāze
5. Kopsavilkums

Kas ir DNS ligase?

DNS ligase ir ferments, kas katalizē fosfodiestera saites veidošanos starp 3 '- OH un 5'-PO₄ nukleotīdu grupas un atvieglo DNS fragmentu savienošanos. Tas ir arī pazīstams kā molekulārais dūrējs. Šī spēja ļauj aizpildīt DNS nepilnības vai niķus un pievienoties Okazaki fragmentiem, kas veidojas DNS replikācijas laikā. DNS ligas ir ļoti noderīgas rekombinantās DNS tehnoloģijā rekombinantās DNS molekulu ražošanai. DNS ligase savieno interesējošo DNS ar vektora DNS. Tāpēc tas ir svarīgs organismu enzīms.

DNS ligase enzīms ir atkarīgs no kofaktora un Mg2⁺ joni tās funkcijai. Ir divi kofaktori, kas palīdz DNS līmēšanā. NAD⁺ darbojas kā baktēriju DNS ligatūru kofaktors, savukārt ATP bieži darbojas kā kofaktoru vīrusa un eikariotu DNS ligas. Eikariotu DNS ligāzes darbība tiek pabeigta, izmantojot trīs galvenos soļus.

01 solis. DNS ligase uzbrūk ATP molekulai un atbrīvo pirofosfātu (divas fosfātu grupas) un AMP un, veidojot ligatīvas-adenilāta starpproduktu, kovalenti saistoties ar iegūto AMP.

02 solis: Izveidotais enzīma AMP starpprodukts pārnes AMP uz nika 5 'fosfātu un veido DNS - adenilātu (DNS šķiedras 5'-fosfāta skābeklis uzbrūk ligeāzes-adenilāta starpposma fosforam).

03. solis: DNS līze katalizē nika 3'-OH uzbrukumu DNS-adenilātam, lai pievienotos polinukleotīdiem un atbrīvotu AMP.

DNS ligas parasti izdala no T4 bakteriofāgas un plaši izmanto rekombinantās DNS tehnoloģijā.

01. attēls: DNS ligase nika labošanā

Kas ir DNS polimerāze?

DNS polimerāze ir visuresošs enzīms, kas atrodas visos organismos, kas iesaistīti DNS sintēzē un genoma replikācijā. Ģenētiskā informācija no vecākiem uz pēcnācējiem tiek nodota ar DNS polimerāžu palīdzību. Tas katalizē jaunu DNS, kas papildina esošo DNS, sintēzi. DNS polimerāze pievieno nukleotīdus (nukleīnskābju veidojošos blokus) grunts secības 3 'OH grupai un turpina virknes veidošanos 5' virzienā. Lielākajai daļai DNS polimerāžu ir no 5 'līdz 3' polimerāzes aktivitāte un 3 'līdz 5' eksonukleāzes aktivitāte korektūrai.

Prokariotu DNS polimerāzes ir aprakstītas piecās galvenajās grupās. Eikarioti satur vismaz 16 dažādas DNS polimerāzes. Visas šīs DNS polimerāzes ir sagrupētas septiņās ģimenēs, proti, A, B, C, D, X, Y un RT (reversā transkriptāze)..

02 attēls: DNS replikācija ar DNS polimerāzes palīdzību

Kāda ir atšķirība starp DNS ligazi un DNS polimerāzi?

DNS ligāze vs DNS polimerāze
DNS ligase ir ferments, kas katalizē fosfodiestera saišu veidošanos starp nukleotīdiem un savieno DNS fragmentus kopā.	DNS polimerāze ir ferments, kas katalizē DNS sintēzi, izmantojot nukleotīdus.
Loma DNS replikācijā
DNS ligase ir papildu enzīms DNS replikācijā, kas pievienojas Okazaki fragmentiem.	DNS polimerāze ir galvenais enzīms DNS replikācijā.
Prasības
Tas ir atkarīgs no Mg2+ joni un ATP / NAD+ kofaktori	Tas ir atkarīgs no šablona, ​​nukleotīdiem, praimeriem un Mg2+.
Funkcijas
DNS līze ir svarīga DNS rekombinācijai, DNS atjaunošanai un DNS replikācijai.	DNS polimerāze ir svarīga DNS replikācijai, DNS atjaunošanai un DNS rekombinācijas tehnoloģijai.

Kopsavilkums - DNS ligase vs DNS polimerāze

DNS līze ir svarīgs enzīms, kas nepieciešams DNS fragmentu savienošanai ar fosfodiestera saitēm. DNS polimerāze ir galvenais enzīms, kas svarīgs jaunas DNS sintēzē. Galvenā atšķirība starp DNS ligatūru un DNS polimerāzi ir to funkcija. Tomēr abi fermenti ir nepieciešami DNS atjaunošanai, DNS replikācijai un rekombinantās DNS tehnoloģijai.

Atsauce:
Rossi, R., A. Montecucco, G. Ciarrocchi un G. Biamonti. "T4 DNS ligase funkcionālais raksturojums: jauns ieskats darbības mehānismā." Nukleīnskābju izpēte. ASV Nacionālā medicīnas bibliotēka, 1997. gada 1. jūnijs. Web. 2017. gada 11. marts
Martins, Ina V. un Stjuarts A. Makneils. “Liberējas no ATP atkarīgas DNS.” Genoma bioloģija. BioMed Central, 2002. Tīmeklis. 2017. gada 11. marts
Garsija-Diaza, Migela un Katarzyna Bebenek. “Daudzkārtīgas DNS polimerāžu funkcijas.” Kritiski pārskati augu zinātnēs. ASV Nacionālā medicīnas bibliotēka, 2007. gada marts. Tīmeklis. 2017. gada 11. marts

Attēla pieklājība:
1. “Ligase nika labošanas mehānisms” Autors: Jrmcnall - ChemDraw (CC BY-SA 3.0), izmantojot Commons Wikimedia
2. “Fāga T7 replikācijas tehnika” Autors Danykl - Savs darbs (CC BY-SA 4.0), izmantojot Commons Wikimedia