Atšķirība starp gēnu kartēšanu un gēnu secību

galvenā atšķirība starp gēnu kartēšanu un gēnu secību ir tā gēna kartēšana ir paņēmiens, kas identificē gēna atrašanās vietu genomā un attālumus starp gēniem, savukārt gēnu sekvencēšana ir tehnika, kas identificē precīzu gēna nukleotīdu secību.

Gēnu kartēšana un gēnu secība ir svarīga ģenētiskajā diagnostikā, lai atrastu un apstiprinātu gēnu klātbūtni. Tādējādi molekulārajām metodēm, piemēram, gēla elektroforēzei un polimerāzes ķēdes reakcijai, ir svarīga loma gēnu kartes secināšanā. Turklāt, lai radītu gēna sekvenci, ir svarīgi izmantot dažādas sekvencēšanas metodes, piemēram, Sanger sekvencēšanu un Next Generation sekvencēšanu..

SATURS

1. Pārskats un galvenās atšķirības
2. Kas ir gēnu kartēšana 
3. Kas ir gēnu secība?
4. Gēnu kartēšanas un gēnu secības līdzības
5. Salīdzinājums blakus - gēnu kartēšana vs gēnu secība tabulas formā
6. Kopsavilkums

Kas ir gēnu kartēšana?

Gēnu kartēšana ir paņēmiens, kā ģenerēt pilnīgu gēnu atrašanās vietu karti hromosomā. Hromosomu kartēšana ir gēnu kartēšanas sinonīms. Turklāt šī metode sniedz informāciju par konkrētiem gēniem, kas atrodas hromosomā. Turklāt gēnu kartēšanā kartēšanas procesā tiek izmantotas fiziskās kartēšanas metodes.

01. attēls. Gēnu kartēšana

Gēnu kartēšana var palīdzēt atrast hromosomu aberācijas. Tādēļ ģenētiskā karte darbojas kā diagnostikas rīks, lai noteiktu tādus apstākļus kā Dauna sindroms un Tērnera sindroms utt. Kariotipēšana ir viena no metodēm, ko var izmantot ģenētiskās kartes ģenerēšanai. Krāsošana ir svarīgs paņēmiens ģenētiskās kartes veidošanā, kurā tiek izmantoti tādi traipi kā etiīdija bromīds, akridīna apelsīns un Giemsa. Gēnu kartēšana var radīt arī saišu kartes, kurās tiek identificēta saistīto gēnu atrašanās vieta.

Kas ir gēnu secība??

Gēnu sekvencēšana ir paņēmiens, ko izmanto, lai identificētu un izsecinātu precīzu gēna bāzes pāru secību. Tādējādi, izmantojot gēnu secību, secināms adenīna, guanīna, timīna un citozīnu bāzu secība secībā. Pirmā visa genoma sekvencēšana notika mikroorganismos. Cilvēka genoma sekvencēšanas projekts bija viens no pagrieziena punktiem molekulārās bioloģijas vēsturē. Pašlaik gēnu secībai ir liela nozīme rūpniecībā un medicīnā. Tas precīzi apstiprina noteikta gēna klātbūtni genomā.

02 attēls: gēnu secība

Gēna secībai ir dažādas metodes. Maksams un Gilberts bija pionieri ķīmiskās metodes ieviešanā gēnu vai DNS secībā. Tomēr potenciāli bīstamo ķīmisko vielu izmantošana noved pie atteikšanās no ķīmisko secību noteikšanas tehnikas. Vēlāk Sangers ieviesa secības paņēmienu, kurā neizmantoja nekādas bīstamas ķīmiskas vielas. Tomēr šobrīd automatizētai sekvencēšanai un nākamās paaudzes sekvencēšanai ir svarīga loma konkrēta gēna secības secināšanā.

Kādas ir līdzības starp gēnu kartēšanu un gēnu secību?

• Abām metodēm ir liela nozīme ģenētiskajā diagnostikā.
• Šīm metodēm ir spēja apstiprināt gēnu klātbūtni genomā.
• Abos procesos var izmantot tādas metodes kā polimerāzes ķēdes reakcija.

Kāda ir atšķirība starp gēnu kartēšanu un gēnu secību?

Galvenā atšķirība starp gēnu kartēšanu un gēnu secību ir informācija, ko rada abi paņēmieni. Gēnu kartēšana sniedz informāciju par konkrēta gēna atrašanās vietu hromosomā, bet gēnu secība rada informāciju par konkrēta gēna bāzes pāru secību. Tomēr abiem paņēmieniem ir nozīme gēna raksturošanā. Tādējādi abu metožu pabeigšanai vajadzīgais laiks un izmaksas atšķiras.

Zemāk esošajā infografikā ir apkopota atšķirība starp gēnu kartēšanu un gēnu secību.

Kopsavilkums - gēnu kartēšana vs gēnu secība

Gēnu kartēšana un gēnu secība ir divas metodes, kas palīdz raksturot gēnu. Kamēr gēnu karte ļauj noteikt gēnu, gēna secība nodrošina šī konkrētā gēna bioķīmiskos datus. Gēnu kartēšana un gēnu secība ir ļoti svarīga ģenētiskos pētījumos un ģenētiskajā diagnostikā. Turklāt abi paņēmieni tagad ir automatizēti, lai nodrošinātu paņēmienu ātru un precīzu izpildi. Informācija, kas iegūta, izmantojot gēnu kartēšanu un gēnu secību, tiek izmantota pakārtotajos procesos molekulārās diagnostikas laikā.

Atsauce:

1. Brauns, Terence A. “Genomu kartēšana”. Genomi. 2nd Edition., ASV Nacionālā medicīnas bibliotēka, 1970. gada 1. janvāris, pieejams šeit.
2. “DNA Sequencing Technologies” Dabas ziņas, Dabas izdevēju grupa, pieejama šeit.

Attēla pieklājība:

1. “NHGRI faktu lapa - ģenētiskā kartēšana (27058469495)”, ko izveidojis Nacionālais cilvēka genoma pētījumu institūts (NHGRI) no Bethesdas, MD, ASV - NHGRI faktu lapa: Ģenētiskā kartēšana (CC BY 2.0), izmantojot Commons Wikimedia
2. “154044” (CC0), izmantojot Pixabay