Atšķirība starp ģenētisko karti un fizisko karti

galvenā atšķirība starp ģenētisko karti un fizisko karti ir paņēmienos, ko izmanto genoma kartēšanā. Ģenerējot ģenētisko karti, gēnu saišu modeļu izpētei izmanto ģenētiskos marķierus un ģenētiskos lokus, savukārt fiziskajā kartēšanā tiek izmantotas molekulārās bioloģijas metodes, piemēram, ierobežojošās fragmenta garuma polimorfisms (RFLP) un hibridizācijas paņēmieni..

Ģenētiskās kartes un fizikālās kartes ir divu veidu kartes, kas konstruētas, lai parādītu gēnus, kas atrodas hromosomās. Viņi iesaistās ģenētiskajā diagnostikā un genoma analīzes prognozēšanā. Turklāt viņi izmanto, lai analizētu attālumus starp gēnu lokusiem un analizētu gēnu polimorfismus.

SATURS

1. Pārskats un galvenās atšķirības
2. Kas ir ģenētiskā karte
3. Kas ir fiziskā karte
4. Ģenētiskās kartes un fizikālās kartes līdzības
5. Salīdzinājums blakus - ģenētiskā karte un fiziskā karte tabulas formā
6. Kopsavilkums

Kas ir ģenētiskā karte?

Ģenētiskā karte balstās uz gēnu lokusiem un ģenētiskajiem marķieriem, kas identificēti, izmantojot saišu analīzi un gēnu asociācijas pētījumus. Mendeļu ģenētika izskaidro ģenētiskās kartes, un Gregors Mendels ir cilvēks, kurš ieviesa šo jēdzienu. Ģenētiskā karte ir noderīga, pētot hromosomu atrašanās vietas un gēnus, kas saistīti ar noteiktu īpašību rašanos. Šie gēni, kurus mantojuši meitas paaudzes, pēc tam tiek identificēti kā ģenētiski marķieri noteiktai slimībai vai raksturam.

01. attēls. Ģenētiskā karte

Pirms ģenētiskās kartes sastādīšanas ir vajadzīgas vairākas selekcijas metodes daudzu paaudžu laikā un pēc tam jāanalizē ciltsdarba paradumi attiecībā uz noteiktu pazīmi vai pazīmi. Gēnu asociācijas pētījumi arī turpmāk palīdz identificēt dažādas alēles, kas ģenētiskajā kartēšanā ir atbildīgas par specifiskiem mantojuma modeļiem. Alēļu frekvences un gēnu frekvences palīdz prognozēt noteikta gēna gēnu karti hromosomā.

Kas ir fiziskā karte?

Gēnu fiziskās kartes, kas tiek konstruētas, izmantojot molekulārbioloģiskās metodes, piemēram, restrikcijas enzīmu šķelšanu utt, ierobežojumu karte ir vēl viens šīs kartes nosaukums. Ģenerējot fizisko karti, sākumā restrikcijas fermenti sagriež DNS fragmentos. Pēc tam šie fragmenti atdalās ar gēla elektroforēzi. Nākamais solis ir DNS fiziskās kartes ģenerēšana. Kā nākamo soli pēc hibridizācijas tos var pakļaut blotēšanas paņēmieniem. Pašlaik tiek izmantotas augstas caurlaides spējas, piemēram, fluorescences in situ hibridizācija, veidojot fiziskas kartes, ko izmantot kā ģenētiskos marķierus.

02. Attēls. Fiziskā karte

Fiziskās kartes ir precīzākas un ātras, salīdzinot ar ģenētiskajām kartēm. Tāpēc to izmantošana gēnu polimorfisma analīzē ir augsta salīdzinājumā ar ģenētiskajām kartēm. Fiziskajā kartēšanā netiek ņemti vērā arī Mendeļa ģenētiskie modeļi.

Kādas ir līdzības starp ģenētisko karti un fizisko karti?

• Abas kartes ir saistītas ar ģenētisko marķieru raksturošanu.
• Genoma mēroga pētījumos tiek izmantotas abas kartes.
• Ģenētiskā karte un fiziskā karte ir noderīga ģenētiskajā diagnostikā.

Kāda ir atšķirība starp ģenētisko karti un fizisko karti?

Ģenētiskā karte ir gēnu karte, kuras pamatā ir gēnu sasaistes un gēnu asociācijas pētījumi, kas veikti ar hromosomas ģenētisko marķieri vai gēnu lokusiem. Fiziskā karte ir gēnu karte, kurā gēnu karti iegūst fiziski, izolējot DNS un iegūstot precīzu ģenētisko marķieri, izmantojot molekulārās bioloģijas metodes. Runājot par metodēm, ko izmanto šajās divās kartēs, atšķirība starp ģenētisko karti un fizisko karti ir tāda, ka ģenētiskajā kartē tiek izmantotas gēnu sasaistes un gēnu asociācijas analīzes metodes, savukārt fiziskajā kartē tiek izmantotas ierobežojumu kartēšanas un hibridizācijas metodes. Tāpēc ģenētiskās kartes precizitāte ir zema, bet fiziskās kartes - augsta.

Salīdzinot šajās divās kartēs izmantoto paņēmienu ātrumu, ģenētiskajā kartē ir mazāk ātras, laikietilpīgas metodes. Tomēr fiziskajā kartē ir ļoti ātras tehnikas. Līdz ar to ģenētiskā karte ir mazāk efektīva, savukārt fiziskā karte ir ļoti efektīva. Turklāt ģenētiskās kartes ir balstītas uz Mendelian mantojuma modeļiem, turpretī fiziskās kartes nav tieši uz Mendelian mantojuma modeļiem.

Kopsavilkums - ģenētiskā karte pret fizisko karti

Genoma pētījumos tiek izmantoti ģenētiski marķieri, kas atrodas hromosomās. Lai izpētītu šos marķierus, tie jākartē, izmantojot dažādas metodes. Mendeļu ģenētika ir ģenētisko karšu pamatā. Ģenētiskās kartēšanas laikā tiek pētītas dažādas pazīmes daudzām paaudzēm un gēni tiek analizēti, izmantojot gēnu sasaistes un gēnu asociācijas pētījumus. Turpretī fiziskās gēnu kartes ietver ģenētisko marķieru izolāciju un raksturošanu fiziski, tos ekstrahējot. Šī ir galvenā atšķirība starp ģenētisko karti un fizisko karti.

Atsauce:

1.O'Rourke, Jamie A. “Ģenētiskās un fizikālās kartes korelācija.” Dzīves zinātņu enciklopēdija, 2014. gada novembris. Pieejams šeit   
2. “Ģenētiskās kartēšanas faktu lapa”. Nacionālais cilvēka genoma pētījumu institūts (NHGRI). Pieejams šeit 

Attēla pieklājība:

1.Fails: NHGRI faktu lapa - ģenētiskā kartēšana (27058469495). Autors: Nacionālais cilvēka genoma pētījumu institūts (NHGRI) no Bethesdas, MD, ASV - NHGRI faktu lapa: Ģenētiskā kartēšana, (CC BY 2.0), izmantojot Commons Wikimedia 
2.'Cilvēka hromosoma Y - 400 550 850 bphs'By Nacionālais biotehnoloģijas informācijas centrs, ASV Nacionālā medicīnas bibliotēka (Public Domain), izmantojot Commons Wikimedia