Atšķirība starp ievietošanas un aizstāšanas vektoriem

galvenā atšķirība starp ievietošanas un aizvietošanas vektoriem ir tas, ka iespraušanas vektoram ir iespēja ievietot mērenā garumā svešas DNS, bet aizvietojošajam vektoram ir iespēja uzņemt lielāku garumu svešas DNS.

Fāgu pārnēsātāji ir bakteriofāgi, ko izmanto klonēšanai. Ir divu veidu fāgu vektori; tie ir ievietošanas vektors un rezerves vektors. Arī visi fāgu vektori sastāv no nebūtiskiem gēniem. Tomēr šie gēni ir jānoņem no fāgiem, lai atvieglotu jaunu svešu DNS ievietošanu.

SATURS

1. Pārskats un galvenās atšķirības
2. Kas ir ievietošanas vektori
3. Kas ir rezerves vektori
4. Līdzības starp ievietošanas un aizstāšanas vektoriem
5. Salīdzinājums blakus - ievietošana vs rezerves vektori tabulas formā
6. Kopsavilkums

Kas ir ievietošanas vektors?

Pirmkārt, ievietošanas vektors ir vienkāršākā lambda klonēšanas vektora forma. Faktiski tas ir fāgu vektora tips, kuram ir unikāla restrikcijas vieta, kas ieviesta vektora genomā izvēles DNS vietā. Turklāt fāgu DNS paliek bez izņemšanas. Šī fāgas DNS neatdalīšana samazina vektora iekšpusē klonējamo ieliktņu (svešās DNS) lielumu. Turklāt šie vektori ir noderīgi cDNS klonēšanā un ekspresijā. GT10, GT11 un Zap ir šī vektora piemēri.

01. attēls: Lambda fāga

Ievietošanas vektors sastāv no vienas atpazīšanas vietas. Šī vektora galvenā funkcija ir attīstīt cDNS bibliotēkas, kas iegūtas no eikariotu mRNS sekvencēm. Turklāt tas var uzņemt tikai svešas DNS garumus no 5 līdz 11 kb. Tam ir arī unikāla šķelšanās vieta svešas DNS ievietošanai.

Kas ir rezerves vektori?

Aizvietojošais vektors vai aizstāšanas vektors ir fāgu vektora tips, kas izveidots, noņemot fāgu DNS vidējo “pildvielas fragmenta” reģionu. Vēlamais svešais DNS ieliktnis aizstāj fāgu DNS.

02. Attēls. Rezerves vektors

Aizvietojošie vektori ir svarīgi, veidojot tādas genomiskās bibliotēkas kā EMBL4 un Charon40. Šie vektori var uzņemt lielāku svešas DNS garumu, kas svārstās no 08 līdz 24 kb garumiem. Piepildījuma reģions sastāv arī no gēna, kas padara fāgu vektoru baktēriju saimnieka iekšienē nedzīvojošu.

Kādas ir līdzības starp ievietošanas un aizstāšanas vektoriem?

• Ievietošanas un aizstāšanas vektori ir fāgu vektori.
• Abos vektoros ir ievietoti sveši DNS ieliktņi.
• Viņi abi ir noderīgi, veidojot DNS bibliotēkas.

Kāda ir atšķirība starp ievietošanas un aizstāšanas vektoriem?

Ievietošana vs rezerves vektori
Ievietošanas vektors ir tāds fāgu vektora tips, kura izvēles fāzē genoma fāzē ir ieviesta restrikcijas vieta.	Aizvietojošais vektors ir fāgu vektora tips, kas izveidots, noņemot fāgu DNS vidējo “pildvielas fragmentu”.
Ieliktņu fragmentu izmērs
05-11 kb garumā	08–24 kb garumā
Pildvielas fragments
Nav pildvielas fragmenta	Pildvielas fragments tiek aizstāts ar svešu ieliktni
Funkcija
Svarīgi ir izveidot cDNA bibliotēkas	Svarīgi genoma bibliotēku izveidē
Piemēri
Piemēri ir GT10, GT11 un Zap	EMBL4 un Charon40 ir piemēri
Izjaukšanas vieta
Ir unikāla šķelšanās vieta	Izjaukšanas vietā ir gēni, kas nav nepieciešami lītiskajam ciklam

Kopsavilkums - ievietošana vs rezerves vektori

Gan ievietošanas, gan aizstāšanas vektori ir divu veidu fāgu vektori. Abiem vektoriem ir restrikcijas vietas, kas atvieglo jaunu svešu DNS ieliktņu izvietojumu. Ievietošanas vektori ir svarīgi, veidojot cDNS bibliotēkas, savukārt aizvietojošie vektori ir svarīgi, veidojot genoma bibliotēkas. Turklāt ievietošanas vektori ir piemēroti vidēja garuma DNS ieliktņiem. Bet aizvietojošie vektori var uzņemt lielāku garumu svešu DNS ieliktņu. Kopumā šī ir galvenā atšķirība starp ievietošanas un aizstāšanas vektoriem.

Atsauce:

1. Hasty, P, et al. “Ievietošanas efektivitāte un aizstāšana ar vektoru mērķauditorijas atlasi mainās dažādos hromosomu lokos.” Molekulārā un šūnu bioloģija, ASV Nacionālā medicīnas bibliotēka, 1994. gada decembris, pieejama šeit.
2. “Lambda ievietošanas vektori.” Bioloģija 335 Lekciju piezīmes - Lambda vektori, pieejami šeit.
3. “Rezerves vektors”. Rezerves vektors - Aizvietojošā vektora - GenScript molekulārās bioloģijas terminoloģija, pieejama šeit.

Attēla pieklājība:

1. Lambānas Kohas “Lambda fāgs” - pašu darbs ar ChemBioDraw (Public Domain), izmantojot Commons Wikimedia