Motīva un domēna atšķirība

galvenā atšķirība starp motīvu un domēnu ir tas, ka motīvs nav patstāvīgi stabils, kamēr domēns ir neatkarīgi stabils.

Olbaltumvielas ir svarīgas bioloģiskās makromolekulas, kas atrodas mūsu ķermenī. No otras puses, gēna ģenētiskais kods noteiks olbaltumvielu aminoskābju secību. Turklāt olbaltumvielām ir primārā, sekundārā un terciārā struktūra. Primārā struktūra ir polipeptīdu ķēdes aminoskābju secība. Kad polipeptīdu ķēdes saliecas viena ar otru, tā veido olbaltumvielu sekundāro struktūru. Alfa spirāles, beta loksnes un super sekundārās struktūras pieder pie sekundārajām struktūrām. Dažas super sekundāro elementu grupas ir zināmas kā olbaltumvielu motīvi. Olbaltumvielas terciārā struktūra attiecas uz tā trīsdimensiju struktūru, kas nosaka olbaltumvielu darbību. Domēns ir salocīta proteīna molekulas sadaļa, kas ir plankumaina un kurai ir diskrēta funkcija. Tā ir galvenā olbaltumvielu funkcionālā un trīsdimensiju struktūra.

SATURS

1. Pārskats un galvenās atšķirības
2. Kas ir motīvs
3. Kas ir domēns
4. Motīva un domēna līdzības
5. Salīdzinājums blakus - motīvs vs domēns tabulas formā
6. Kopsavilkums

Kas ir motīvs?

Motīvs ir noteikta olbaltumvielu super sekundāro elementu, piemēram, alfa heliku un beta struktūru, grupa. Tie ir sava veida raksti, kas atrodas dažādās olbaltumvielās. Motīvi apraksta sekundāro konstrukcijas elementu locīšanas modeļus un to mijiedarbību. Šie locīšanas raksti stabilizējas ar līdzīgām saitēm, kas atrodas terciārajās struktūrās. Tomēr tās nav tik sarežģītas kā terciāras struktūras.

01. attēls: motīvs

Tās ir vienkāršas olbaltumvielu sekundāro struktūru kombinācijas. Motīvs pats par sevi nav stabils. Turklāt motīvi izskaidro olbaltumvielu struktūru, bet neparedz olbaltumvielu funkcijas. Olbaltumvielu motīvu piemēri ir beta-alfa-beta motīvs, grieķu atslēgas motīvs, Beta muca, Beta-meander motīvs utt..

Kas ir domēns?

Domēns ir galvenā, funkcionālā un trīsdimensiju olbaltumvielu vienība. Tas veic noteiktu funkciju. Vienam proteīnam var būt vairāki atšķirīgi domēni. Katrs domēns ir neatkarīga vienība. Tā ir globāla struktūra. Tas ir atbildīgs par noteiktu funkciju vai mijiedarbību. Domēnus var izmantot, lai izvirzītu hipotēzi par neraksturīga proteīna funkciju. Analizējot olbaltumvielu, ir svarīgi ņemt vērā, jo domēni ir olbaltumvielu funkcionālās vienības.

02 attēls: trīs dažādi piruvāta kināzes domēni

Domēni ir ļoti stabilas un kompaktas struktūras. Tos var viegli atšķirt no citiem reģioniem. Piruvāta kināzei ir trīs atšķirīgi domēni, kā parādīts 02. attēlā. Domēna garums var mainīties, un vidējais garums ir 100 aminoskābes. Katrā domēnā ir hidrofobā kodols, kas izveidots no sekundārajām struktūrvienībām. Vairāki domēni kopā veido olbaltumvielu terciāro struktūru.

Kādas ir motīva un domēna līdzības?

• Motīvs un domēns ir vienības, kas atrodas pašās olbaltumvielu molekulās.
• Tie ir noderīgi, klasificējot olbaltumvielu ģimenes.

Kāda ir atšķirība starp motīvu un domēnu?

Motīvs ir noteikta olbaltumvielu super sekundāro elementu, piemēram, alfa heliku un beta struktūru, grupa, kamēr domēns ir olbaltumvielu funkcionālā vienība. Turklāt motīvs ir sekundāra struktūra, savukārt domēns ir atbildīgs par olbaltumvielu terciāro struktūru. Turklāt domēns ir neatkarīga vienība atšķirībā no motīva. Tāpat domēns attēlo olbaltumvielu funkciju, kamēr motīvs nav. Šīs ir galvenās atšķirības starp motīvu un domēnu. Zemāk esošajā infogrāfijā tabulas veidā parādīta atšķirība starp motīvu un domēnu.

Kopsavilkums - Motīvs vs Domēns

Motīvs ir olbaltumvielu molekulas sekundāro struktūru izkārtojums. Atšķirībā no domēna, tas pats par sevi parasti nav stabils. Domēns ir patstāvīgi stabila olbaltumvielu struktūra. Tāpēc tā var būt daļa vai visa olbaltumvielu molekula. Tā ir olbaltumvielu trīsdimensiju funkcionālā pamatvienība. Turklāt tam ir funkcija, un tā ir neatkarīga vienība. Motīvs var būt domēna daļa. Bet domēns nevar būt motīva sastāvdaļa. Šī ir atšķirība starp motīvu un domēnu.

Atsauce:

1. “Olbaltumvielu domēns”. Wikipedia, Wikimedia Foundation, 2018. gada 31. jūlijs. Pieejams šeit

Attēla pieklājība:

1. “Anthrax toksīna olbaltumvielu atslēgas motīvs” Autors: NatelewisAtvasinātais darbs (CC BY-SA 3.0), izmantojot Commons Wikimedia
2. Tomasa Šplettstoesera “Piruvāta kināzes proteīna domēni” - Savs darbs, (CC BY-SA 3.0), izmantojot Commons Wikimedia