Atšķirība starp mērķtiecīgu un neorientētu proteomiku

Galvenā atšķirība starp mērķtiecīgu un nemērķtiecīgu proteomiku ir tā, ka mērķtiecīgas proteomikas mērķis ir noteikt specifiska olbaltumvielu pārpilnību, kamēr nemērķtiecīga proteomika nav vērsta uz noteiktu olbaltumvielu.

Proteomika ir olbaltumvielu, to struktūru un funkciju plaša mēroga izpēte. Tas pēta visu olbaltumvielu kompleksu šūnā, audos vai organismā īpašos apstākļos. Ir divu veidu proteomika kā mērķtiecīga proteomika un nemērķtiecīga proteomika.

SATURS

1. Pārskats un galvenās atšķirības
2. Kas ir mērķa proteomika
3. Kas ir bezmērķīga proteomika
4. Mērķtiecīgas un ne-mērķētas proteomikas līdzības
5. Salīdzinājums blakus - mērķtiecīga vai neplānota proteomika tabulas formā
6. Kopsavilkums

Kas ir mērķtiecīgā proteomika?

Kā norāda nosaukums, mērķtiecīga proteomika analīzei ir mērķēta uz noteiktu olbaltumvielu vai peptīdu sarežģītā olbaltumvielu maisījumā. Tad tas analizē šī iepriekš atlasītā specifiskā proteīna klātbūtni un daudzumu. Šī metode ir iespējama tikai vienam paraugam vai vairākiem paraugiem. Šī metode ir piemērota pat noteiktai olbaltumvielu grupai. Tā rezultātā tiek iegūti precīzāki, kvantitatīvi un sensitīvi dati. Turklāt masas spektrometrija apvienojumā ar mērķtiecīgu proteomiku nodrošina precīzākus un ticamākus mērījumus. Šīs metodes analīzei izmanto trīskāršā kvadrupola masas spektrometru (QQQ).

01. attēls. Proteomika

Mērķtiecīga proteomika ir piemērota metode, ja vēlaties pārbaudīt, vai notriekšanas mērķis faktiski tiek notriekts vai kad vēlaties noteikt noteiktu olbaltumvielu / peptīdu daudzumu asins serumā, smadzeņu šķidrumā vai šūnu lizātā utt. Varat arī izmantot, ja vēlaties lai pārbaudītu, vai konkrētais proteīns ir atšķirīgi izteikts paraugos vai laika gaitā veiktā eksperimenta laikā.

Kas ir bezmērķīga proteomika?

Neizvirzītā proteomika, kā minēts nosaukumā, tās analīzei nav mērķēta uz noteiktu olbaltumvielu vai peptīdu. Atklāšanas proteomika ir vēl viens nosaukums Neizdomātajai proteomikai. Faktiski tā ir “globālāka” analīze. Parasti mērķtiecīgas proteomikas veikšana ir atbilde uz jautājumu “kādi proteīni vai olbaltumvielas ir šajā paraugā vai vairākos paraugos?”. Šī metode nav jutīga kā mērķtiecīga proteomika. Bet tas var identificēt un izmērīt daudzus proteīnus, ieskaitot jaunus proteīnus. Neizvirzīta proteomika var dot gan kvantitatīvus, gan kvalitatīvus mērījumus.

Kādas ir līdzības starp mērķtiecīgo un neizvirzīto proteomiku?

• Gan mērķtiecīga, gan neplānota proteomika mēra olbaltumvielas paraugos.
• Tie ir svarīgi proteomu analīzē.
• Šīs metodes izmanto masas spektrometriju.

Kāda ir atšķirība starp mērķtiecīgu un neorientētu proteomiku?

Pirmkārt, mērķtiecīga proteomika ir noteikta proteīna vai peptīda klātbūtnes un daudzuma noteikšana kompleksajā olbaltumvielu maisījumā. Turpretī nemērķtiecīga proteomika ir paraugā vai paraugos esošo olbaltumvielu kvantitatīvais un kvalitatīvais pētījums, nevirzoties uz noteiktu olbaltumvielu. Mērķtiecīgu proteomiku veic ar iepriekš atlasītiem vai mērķtiecīgiem proteīniem, bet mērķtiecīgu proteomiku veic, lai noskaidrotu olbaltumvielu veidus šajā paraugā. Turklāt mērķtiecīga proteomika ir jutīgāka nekā nemērķtiecīga proteomika.

Kopsavilkums - Mērķtiecīga vs Neizvirzīta proteomika

Apkopojot, mērķtiecīga un nemērķtiecīga proteomika ir divu veidu olbaltumvielu pētījumi. Kā norāda viņu nosaukumi, mērķtiecīga proteomika ir mērķēta uz noteiktu olbaltumvielu, bet nemērķtiecīga proteomika nav vērsta uz noteiktu olbaltumvielu. Tā ir atšķirība starp mērķtiecīgu un nemērķtiecīgu proteomiku.

Atsauce:

1. “Mērķtiecīga proteomika.” UC Davis Proteomics Core, pieejams šeit.
2. “Proteomika / Ievads proteomikā.” Mūzikas teorija / režīmi - Wikibooks, atvērtās grāmatas atvērtai pasaulei, pieejami šeit.

Attēla pieklājība:

1. “Proteomics” Autors Xxl7441 angļu valodā Wikibooks - Pārvietots no en.wikibooks uz Commons (Public Domain), izmantojot Commons Wikimedia