Atšķirība starp Ti un Ri Plasmid

Galvenā atšķirība - Ti vs Ri Plasmid
 

Agrobacterium ir baktēriju ģints, kas divdīgļlapu augos izraisa vairākas slimības, tai skaitā vainaga žultsakmeņu un matains sakņu slimības. Šīs abas slimības kodē gēni, kas atrodas baktēriju plazmidās (nehromosomālajā DNS). Baktēriju sugas Agrobacterium tumerfaciens nes a audzēju inducējošā plazmidija (Ti plazmīda), kas ir atbildīga par vainaga žultsskābju augiem. Agrobacterium rhizogenes ir vēl viena baktērija, kas uzturas saknes inducējošā plazmid (Ri plazmid), kas ir atbildīga par augiem mataino sakņu slimību. Ti un Ri plazmīdas ir patogēnas plazmīdas, kas raksturīgas tikai šai baktēriju ģintij. Galvenā atšķirība starp Ti un Ri plazmīdu ir tā Ti plazmīdu kodē ar gēniem, kas ir atbildīgi par vainaga žultspūšļa slimības izraisīšanu, savukārt Ri plazmīdu kodē ar gēniem, kas paredzēti augiem apmatojuma sakņu slimībai. Šīs patogēnās plazmīdas satur gēnu kopas, kas atbildīgas par DNS replikāciju, virulenci, T-DNS, opīna izmantošanu un konjugāciju. Infekcijas laikā, Agrobacterium izdala savu plazmides T-DNS (pārneses DNS) reģionu un integrējas ar augu genomu, lai izraisītu slimības. Šo spēju izmanto molekulārie biologi, lai gēnu inženierijā ieviestu augos svarīgus gēnus. Līdz ar to, Agrobacterium tiek uzskatīts par svarīgu instrumentu biotehnoloģijā un molekulārajā bioloģijā, lai ieviestu kimēru DNS dažādās augu sugās.

SATURS
1. Pārskats un galvenās atšķirības
2. Kas ir Ti Plasmid
3. Kas ir Ri Plasmid
4. Blakus salīdzinājums - Ti vs Ri Plasmid
5. Kopsavilkums

Kas ir Ti Plasmid?

Audzēju inducējošā plazmidija (Ti plazmīda) ir lielāka plazmīda, kuru pārnēsā Agrobacterium tumerfaciens izraisīt vainaga žults slimību visdažādākajos divdīgļlapu augos. Nosaukums vainaga žults slimība tiek izmantota tāpēc, ka augu vainagā virs augsnes virsmas veidojas liels audzējs, piemēram, pietūkumi (žults), jo augu hormoni pārlieku ražo auksīnu un citokinīnus. A. tumerfaciens. T-DNS reģions satur audzēju inducējošos gēnus. Agrobacterium tumerfaciens iekļūst augos caur bojātiem augu audiem, īpaši caur brūcēm, un savu daļu no plazmīdu DNS (T-DNS) pārnes augu šūnās kopā ar slimību izraisošajiem gēniem. Pēc tam šī T-DNS integrējas augu šūnu genomā un tiek transkribēta. Gēnu ekspresija izraisa audzēju veidošanos un saistītās izmaiņas šūnu metabolismā. Vainaga žults slimība vecākiem augiem nopietnu kaitējumu nerada. Tomēr tas samazina stādu stādu kvalitāti.

Sakarā ar šo unikālo infekcijas veidu, A. tumerfaciens tiek plaši izmantots kā līdzeklis ģenētiskajā inženierijā transgēnu augu ražošanai. Audzēju ierosinošie gēni tiek nomākti, un vēlamie gēni, piemēram, pret insekticīdiem izturīgi gēni un pret herbicīdiem izturīgi gēni, tiek ievietoti vai rekombinēti Ti plazmidē, izmantojot rekombinantās DNS tehnoloģiju, un tiek izmantoti augu selekcijas programmās. Kad T-DNS tiek nodots, inficējot A. tumerfaciens augiem augi dabiski iegūst vēlamo gēnu iedarbību. Tāpēc jebkuru T-DNS ievietotu svešu DNS var integrēt augu šūnu genomos, izmantojot šīs baktērijas dabisko infekcijas procesu.

01. attēls. Ti plazmid A. tumerfaciens

Kas ir Ri Plasmid?

Sakņu inducējošā plazmidija (Ri plazmīda) ir plazmīda, kuru nes baktērija A. rhizogenes.  Ri plazmīds ir atbildīgs par slimību, ko sauc par mataino sakņu slimību divkāju augos. Infekcija A. rhizogenes izraisa plašu nejaušu sakņu veidošanos infekcijas vietā vai tās tuvumā. Matains saknes inducējošie gēni atrodas Ri plazmides T-DNS reģionā. Ri plazmīda ir lielāka plazmīda, līdzīga Ti plazmīdai. A. rhizogenes ir arī spējīgs pārnest RI plazmides T-DNS reģionu augu šūnās un integrēties ar augu šūnu genomu, lai iegūtu transkripcijas, izmantojot augu šūnu iekārtas, lai izraisītu slimības. Tādējādi Ri plazmīdas kalpo arī par nozīmīgiem vektoriem augu gēnu inženierijā.

Kāda ir atšķirība starp Ti un Ri Plasmid?

Ti vs Ri Plasmid
Ti plazmīda ir apaļa un lielāka plazmīda, kuru audzē A. tumerfaciens	Ri plazmīda ir apļveida un lielāka plazmīda, kuru audzē A.rizogeni
Slimība
Ti plazmidē kodē gēnus vainaga žults slimības augos	Ri plazmide kodē gēnus matētu sakņu slimībai divdīgļlapu augos.

Kopsavilkums - Ti vs Ri Plasmids

Ti un Ri plazmīdas ir patogēnas plazmīdas, kuras satur A. tumerfaciencs un A. rhizogenes, attiecīgi. Ti plazmidā ir audzēju inducējoši gēni, kas augos izraisa vainaga žultsakmeņu slimības. Ri plazmīdā ir saknes inducējoši gēni, kas augos izraisa matainu sakņu slimību. Šī ir galvenā atšķirība starp Ti un Ri plazmīdām. Šīs plazmīdas var izmantot kā pārnēsātājus augu ģenētiskajā inženierijā, ņemot vērā to dabisko spēju pārnest daļu no savas plazmīda DNS uz saimnieka genomu. Tie satur gēnu kopas un ir aptuveni 200 kbp. Katrā plazmīdā ir unikāli gēni.

Atsauces
1. Katsunori Suzuki, Katsuyuki Tanaka, Shinji Yamamoto, Kazuya Kiyokawa, Kazuki Moriguchi un Kazuo Yoshida. 2. “Ti un Ri plazmīdas.” Springers. Springer Berlin Heidelberg, 1970. gada 1. janvāris. Web. 2017. gada 21. aprīlis
3. Zupāns, J. R. un P. Zambryski. “T-DNS pārvietošana no Agrobacterium uz augu šūnu.” Augu fizioloģija. ASV Nacionālā medicīnas bibliotēka, 1995. gada aprīlis. Web. 2017. gada 22. aprīlis

Attēla pieklājība:
1. Mouagip “Ti plazmid” Šis vektorgrafikas attēls tika izveidots, izmantojot Adobe Illustrator. - Savs darbs (CC0), izmantojot Commons Wikimedia