Agaroze pret poliakrilamīdu
Ar agarozi un poliakrilamīdu ir dažādas atšķirības, ieskaitot to fizikālo uzbūvi, toksicitāti un ieliešanas paņēmienus, kā arī cenu. Ir noderīgi zināt šīs atšķirības, kā arī to līdzības, ja jums ir darīšana ar kādu no šiem gēlu veidiem.
Viena no galvenajām atšķirībām starp šiem diviem gēliem ir tā, ka agarozi ielej horizontāli, bet poliakrilamīdu - vertikāli. Šādā horizontālā veidā ir daudz vieglāk ielej agarozi. Agarozi var uzkarsēt, lai atvieglotu ieliešanas procesu, lai gan to nevajadzētu karsēt tik intensīvi, lai agaroze izkūst. Var arī izlemt, vai agarozes ieliešanai izmantot šauras vai platas joslas. To var ieliet, izmantojot šo rievošanas metodi, un šī ir viena no tās priekšrocībām. Ielejot, jābūt ārkārtīgi uzmanīgam, jo agaroze ir ļoti maiga un viegli saplīst.
No otras puses, kā minēts, poliakrilamīdu ielej vertikāli. Poliakrilamīdam ir vajadzīgas stikla plāksnes, lai palīdzētu šajā procesā, jo tā struktūra ir ļoti plāna, un šis papildu atbalsts ir nepieciešams. Atšķirībā no agarozes, poliakrilamīdu nevar atkārtoti sasildīt un pēc tam ielej.
Agaroze sastāv no daudzām molekulām, savukārt poliakrilamīds parasti sastāv tikai no vienas lielas molekulas. Agarozes molekulas tiek turētas kopā ar starpmolekulāriem spēkiem, un molekulas veido DNS. Ir lielas un mazas molekulas, un parasti lielākās molekulas ir vieglāk atdalāmas nekā mazākās. Poliakrilamīda molekulu veido DNS vai olbaltumvielas. Starp poliakrilamīda želejām ir mazākas spraugas nekā starp agarozes želejām, kas ir vēl viena atšķirība starp šīm divām vielām. Ja josrozes joslu izmēri ir vienādi, poliakrilamīdā ir dažādi joslu izmēri. Ja poliakrilamīda molekula tiek pakļauta gaisam, tā nesacietēsies vienmērīgā veidā, jo gaiss paātrina polimerizācijas procesu.
Runājot par toksicitāti, agaroze tiek uzskatīta par netoksisku vielu. Kaut arī poliakrilamīds tiek uzskatīts par tādu pašu, tā pulveris tiek uzskatīts par toksisku, un ir saprātīgi pat rīkoties ar želejām ar aizsardzības līdzekļiem.
Poliakrilamīdu izmanto gēlu un olbaltumvielu gēlu sekvenēšanai. Tās priekšrocības ir tādas, ka tai ir viegli krāsojošas īpašības, un to var nožūt, veidojot želeju. Tas tiek nopirkts iepriekš ielejams un ir lētāks nekā agaroze, apmēram 5 USD “7” par želeju. (Agaroze ir apmēram USD 1 par gramu). Personai ieteicams iegūt pietiekamu pieredzi pirms kāda no šiem diviem gēliem iegādes, jo bieži pirms pirkuma ir jāzina nepieciešamais paraugu skaits un nepieciešamā gēla koncentrācija..
Kopsavilkums:
1. Agarozi ielej horizontāli, bet poliakrilamīdu - vertikāli.
2. Agaroze ir dārgāka nekā poliakrilamīds.
3. Agaroze sastāv no daudzām molekulām, savukārt poliakrilamīds sastāv tikai no vienas lielas molekulas.
4.Atšķirībā no poliakrilamīda, agarozi var atkārtoti sasildīt.
5.Agaroze tiek uzskatīta par netoksisku vielu visās tās formās, savukārt poliakrilamīda pulveris ir noteikts kā toksisks.