Klasificējot eikariotu organismus kā augus vai protistus, ir svarīgi ņemt vērā, ka augi pieder pie Plantae Kingdom. Protisti neveido vienotu valstību, jo viņi nav attīstījušies no kopīga senča. Faktiski sugu, kas pazīstamas kā protisti, spektrs ir tik atšķirīgs, ka dažām no tām nav vairāk nekā viena ar otru, nekā tas ir ar augiem. [I] Lai pierādītu šo dažādību, ņemiet vērā faktu, ka kodola genoma izmēri augos atšķiras koeficients ir 1000, savukārt protista genomi atšķiras līdz 300 000 reizes. [ii]
Augu šūnās esošajām DNS kodolām ir augstāka sarežģītība nekā protistiem. Tas notiek tāpēc, ka ir gēni, kas dod iespēju augu šūnām diferencēties noteiktos tipos pēc struktūras un funkcijas. Totipotence noved pie specializētu audu veidošanās, un tādējādi augi var attīstīties sarežģītākos organismos nekā protisti.
Faktiski atšķirībā no protistiem visi augi ir daudzšūnu. Daži protisti ir vienšūni, savukārt citi dzīvo neatkarīgu šūnu kolonijās, kas sazinās un sadarbojas, piemēram, barojot un pārvietojot. Šīs kolonijas ir unikālas protistu grupai. Vēl citi protisti, piemēram, jūraszāles, ir daudzšūnu un pat sasniedz salīdzinoši lielus izmērus. [Iii]
Augi ir primārie ražotāji; tie ir autotrofi, kas ražo pārtiku no neorganiskām molekulām. Nav tādu parazītisko augu, kas barības vielas paļaujas uz citiem augiem. Daži protisti, piemēram, aļģes, ir autotrofi, kas līdzīgā veidā veic fotosintēzes procesu, izmantojot hloroplastus. Tomēr citi protisti iegūst barības vielas organisko molekulu veidā, tāpēc tos sauc par heterotrofiem vai patērētājiem.
Protistu grupā, kas pazīstama kā “vienšūņi”, ietilpst vairākas plēsēju un parazītu sugas, kas barojas ar baktērijām un citiem protistiem. Ir zināmi daži protisti, kas izraisa cilvēku un dzīvnieku slimības. Vēl citi protisti, piemēram, sārņu veidnes, ir līdzīgi sēnītēm un darbojas kā sadalītāji.
Augiem ir nepieciešams skābeklis šūnu elpošanas procesam. Šeit protisti atšķiras. Kaut arī daži protisti ir arī aerobi, dažas protistu sugas ir fakultatīvi anaerobi, kas spēj sadalīt ogļhidrātus bez skābekļa klātbūtnes. Ir pat obligātas anaerobās protistu sugas, kas atrodamas dubļos un dzīvnieku gremošanas traktos. Dažiem augu audiem var būt fakultatīvas aerobās adaptācijas. [Iv]
Daudziem protistiem ir specializētas šūnu struktūras, kas palīdz kustēties un baroties, un darbojas kā maņu orgāni. Flagellas ir astei līdzīgas struktūras, kas kalpo organismu izdzīšanai ar peldēšanai līdzīgu kustību. Cilia ir īsākas, matiem līdzīgas struktūras, kas lielos daudzumos parasti atrodas šūnu membrānas ārpusē. Šūnu paplašinājumiem, kas pazīstami kā pseidopodija, ir maņu loma pārtikas atrašanā un apņemšanā, kā arī protista pārvietošanā..
Savukārt augi ir nekustīgas dzīvības formas. Kustības aprobežojas ar viena auga indivīda orgānu pārvietošanos, ko sauc par tropismiem. Fototropisms ir augu daļu pārvietošanās pret saules gaismu, savukārt tigmotropisms ir kustība, reaģējot uz fiziskiem stimuliem, piemēram, cīpslu savijšanu.
Ģimnāziju un angiospermu veido sporas un sēklas attiecīgi, lai seksuālās reprodukcijas ceļā pavairotu nākamās augu paaudzes. Gametas tiek transportētas apputeksnēšanas laikā. Aseksuālā (veģetatīvā) reprodukcija ir izplatīta arī tādos augos kā sīpoli un bumbuļi. Sīpoli un kartupeļi, veidojot jaunus pumpurus, veido jaunus pēcnācējus, un zemenēm attīstās nejaušas saknes, kuras sauc par stoloniem, kas rada jaunus augus. [V] Protisti var pavairot seksuāli ar mejozes palīdzību vai aseksuāli ar vienkāršu šūnu dalīšanu; augi nespēj vairoties vienā mitotiskā dalījumā. Kaut arī daži sēnītei līdzīgi protisti ražo sporas, neviens neražo sēklas.
Evolūcijas pielāgošanās dēļ augi ir kolonizējuši pasaules sauszemes biotopus. Charophyta, zaļo aļģu patvērums, ir vienīgais protists, kas ražo sporopollenīnu, ūdens izturīgu polimēru. Sporanbija sienas, kas aizsargā augu zigotus sporangijas iekšpusē no izžūšanas, satur šo sporopollenīna savienojumu. Tādējādi Charophyta tiek uzskatīts par protista ciltsrakstu, no kura attīstījās sauszemes augi. Turpretī protisti ir ļoti atkarīgi no ūdens klātbūtnes, lai nodrošinātu sugu izdzīvošanu, daudz vairāk nekā sauszemes augu sugas..
Protisti ir ierobežoti līdz ūdens biotopiem. Augu sugas var būt ūdens vai sauszemes.