Atšķirība starp maksimālo Parsimony un Maksimālo iespējamību

galvenā atšķirība starp maksimālo garu un maksimālo varbūtību ir atkarīgs no metodes, ko izmanto filoģenētiskā koka izstrādē. Maksimālā apreibināšanās ir vērsta uz kopējo rakstzīmju stāvokļu samazināšanu filoģenētiskā koka konstruēšanas laikā, savukārt maksimālā iespējamība ir statistiska pieeja filoģenētiskā koka zīmēšanai atkarībā no iespējamības starp ģenētiskajiem datiem..

Filoģenēze ir jauna pieeja organismu klasificēšanai un nomenklatūrai. Filoģenēze balstās uz ģenētiskajiem datiem un evolūcijas attiecībām. Ģenētiskie dati ir DNS secības rezultāts. Filoģenēzē organismu klasifikācija notiek, pamatojoties uz kopējo senču. Maksimāla filoģenētiskas attiecības un maksimāla varbūtība palielina filoģenētiskā koka precizitāti un uzticamību.

SATURS

1. Pārskats un galvenās atšķirības
2. Kas ir maksimālā Parsimony 
3. Kāda ir maksimālā iespējamība
4. Līdzības starp maksimālo Parsimony un Maksimālo iespējamību
5. Salīdzinājums blakus - maksimālā Parsimony vs Maksimālā iespējamība tabulas formā
6. Kopsavilkums

Kas ir maksimālā Parsimony?

Maksimālās parsimonijas metodē filoģenētiskās analīzes laikā kopējo raksturu stāvokļa izmaiņu samazināšana notiek līdz minimumam. Filoģenētika ir bioloģijas nozare, kas nodarbojas ar evolūcijas attiecību izpēti. Filoģenētiskais koks ir koks, kas parāda evolūcijas attiecības, kuru pamatā ir kopīgs sencis. Tādējādi, uzzīmējot filoģenētisko koku, izmantojot maksimālās parsimonijas jēdzienu, paralēlas evolūcijas daudzums tiek samazināts līdz minimumam. Tāpēc maksimālā uzdrīkstēšanās koku ģenerēs daudz ātrāk nekā citas metodes. Tas ir tāpēc, ka maksimālajā apliecinājumā tiek ņemtas vērā tikai galvenās atšķirīgās pazīmes.

01. attēls. Maksimālā parsimonija

Zīmējot maksimāli pateicīgu koku, koks vienmēr ir pēc iespējas īsāks un ar minimālu taksonu skaitu. Tomēr maksimāli slavenā koka ticamība ir ļoti augsta. Filoģenētisko attiecību statistiskā konsekvence un precizitāte, kas balstīta uz maksimālo atļauju, būs atšķirīga. Turklāt pastāv sarežģīti algoritmi, kas analizē maksimālo filoģenētisko attiecību apliecinājumu.

Kāda ir maksimālā iespējamība?

Maksimālā iespējamība ir viena no visbiežāk izmantotajām statistikas metodēm, kas analizē filoģenētiskās attiecības. Metode analizēs filoģenēzi, pamatojoties uz varbūtības modeli. Turklāt šī metode ņem vērā gan vidējo, gan dispersiju. Tādējādi filoģenēzē tiek iegūta maksimāla iespējamība, ņemot vērā konkrētā organisma dotos ģenētiskos datus.

02. Attēls: maksimālā iespējamība

Maksimālās iespējamības statistiskās metodes izmantošanai ir gan priekšrocības, gan trūkumi. Metode ir ļoti piemērota, analizējot vienkāršu datu kopu, kas satur ģenētisko informāciju. Ja ģenētisko datu dispersijas pakāpe ir zemāka, maksimālie iespējamības rādītāji ir ticami. Rezultāti, kas iegūti, izmantojot maksimālu varbūtību, vēl vairāk apstiprina maksimālās izrēķināšanas balles noteiktā filoģenētiskajā attiecībā. Tāpēc maksimālās iespējamības analīze darbojas kā apstiprinošs tests.

Salīdzinot ar iepriekšminētajām priekšrocībām, šī metode ir lēns un intensīvs process. Turklāt, ja nav vienas datu kopas, ir daudz kļūdu. Tādējādi tas arī apgrūtina rezultātu atkārtojamību, izmantojot maksimālās iespējamības novērtējumu.

Kādas ir līdzības starp maksimālo Parsimony un Maksimālo iespējamību?

• Maksimālā apreibināšanās un maksimālā iespējamība ir divas pieejas, kurām ir liela nozīme filoģenēzijā.
• Abas metodes attēlo organisma attiecības ar tā senču, pamatojoties uz pieejamajiem ģenētiskajiem datiem.
• Filoģenētiskos kokus var interpretēt, izmantojot gan maksimālo parsimoniju, gan maksimālo varbūtību.
• Abos paņēmienos ģenētiskie dati balstās uz DNS vai RNS secību.
• Abas metodes ir svarīgas filoģenētisko koku veidošanā.

Kāda ir atšķirība starp maksimālo Parsimony un Maksimālo iespējamību?

Gan maksimālā apžēlošana, gan maksimālā iespējamība ir divas atšķirīgas pieejas filoģenētiskā koka interpretācijā. Maksimālais apreibums tic analizēt dažas pazīmes un mazināt rakstura izmaiņas no organisma uz organismu. Turpretī maksimālās iespējamības metode ņem vērā gan vidējo, gan dispersiju un iegūst maksimālu varbūtību attiecībā uz konkrētā organisma dotajiem ģenētiskajiem datiem. Tātad, šī ir galvenā atšķirība starp maksimālo garu un maksimālo varbūtību.

Turklāt secinājuma izdarīšanai nepietiek tikai ar maksimālo aplamības ticamību. Bet maksimālās iespējamības metode darbojas kā apstiprinošs maksimālās surimonijas rezultātu tests. Tādējādi secinājumi būtu jāizdara, izmantojot gan maksimālo atzinību, gan maksimālo varbūtību.

Zemāk redzamajā infografikā ir apkopota atšķirība starp maksimālo apžēlošanu un maksimālo iespējamību.

Kopsavilkums - maksimālā Parsimony vs Maksimālā iespējamība

Filogēnijai ir liela nozīme evolūcijas attiecību veidošanā, veidojot filoģenētiskos kokus. Maksimālā parsimonija ir koku konstruēšanas paņēmiens ar minimālu rakstzīmju stāvokļa izmaiņu skaitu. Turpretī filoģenētiskā koka maksimālā iespējamība ir atkarīga no ģenētisko datu maksimālas līdzības izmantošanas. Abu analīžu dati nāk no DNS vai RNS sekvences datiem. Uzticamība un precizitāte ir augsta, ja koku būvniecība notiek, izmantojot abus paņēmienus. Tādējādi tas apkopo atšķirību starp maksimālo surimoniju un maksimālo varbūtību.

Atsauce:

1. Elliott. “Konkurss starp Parsimony un iespējamību.” OUP akadēmiskais, Oxford University Press, 2004. gada 1. augusts, pieejams šeit.

Attēla pieklājība:

1. Taboada-Echalar P, Álvarez-Iglesias V, Heinz T, Vidal-Bralo L, Gómez-Carballa A, Catelli L, et al., “Maksimālais B2b haplogrupu pēdu koks”. (2013) Pirmkoloniāla perioda ģenētiskais mantojums mūsdienu Bolīvijā. PLOS ONE 8 (3): e58980. doi: 10.1371 / journal.pone.0058980 (CC BY 2.5), izmantojot Commons Wikimedia
2. Lietotāja “Lactarius blennius un relativs maksimālās iespējamības koks”: Thkgk - Savs darbs (CC0), izmantojot Commons Wikimedia