Atšķirība starp kraušanas želeju un atdalošo želeju

Galvenā atšķirība - kraušanas želeja vs atdalīšana Želeja
 

SDS-PAGE tehnikas skaidrojumā tiek izmantoti termini kraušanas želeja un atdalīšanas želeja. SDS-PAGE vai nātrija dodecilsulfāta-poliakrilamīda gela elektroforēze ir laboratorijas paņēmiens, ko izmanto olbaltumvielu molekulu atdalīšanai, pamatojoties uz to molekulmasu. Metodes pamatā ir teorija, ka olbaltumvielām ar atšķirīgu molekulmasu ir atšķirīgs migrācijas ātrums; zema molekulmasa molekulas migrē ātrāk, turpretī augstas molekulmasas molekulas migrē lēnām. Migrācijas vide ir želeja. Ir divu veidu želejas, kuras nosauktas par kraušanas želeju un atdalošo želeju. galvenā atšķirība starp kraušanas želeju un atdalīšanas želeju ir tas kraušanas želejas pH ir 6,8, turpretī atdalošā gela pH ir 8,8.

SATURS

1. Pārskats un galvenās atšķirības
2. Kas ir kraušanas želeja
3. Kas ir atdalīšanas želeja
4. Saikne starp želeju kraušanu un atdalīšanas želeju
5. Salīdzinājums blakus - želejas salikšana vs atdalīšanas želeja tabulas formā
6. Kopsavilkums

Kas ir kraušanas želeja?

Kraušanas želeja ir mazkoncentrēts poliakrilamīda gēls, kas SDS-PAGE tehnikā tiek novietots koncentrētāka izšķirošā gela (atdalošā gela) virspusē. Kraušanas želeju izmanto, lai uzlabotu elektroforēzes izšķirtspēju. Izšķirtspēja palielinās, pateicoties atšķirībai starp sakraušanas želejas un izšķirošā gela koncentrācijām, kas ietekmē olbaltumvielas paraugā. Tā kā poliakrilamīda koncentrācija kraušanas želejā ir zema, poru lielums ir lielāks. Tas arī palīdz palielināt atdalīšanu.

Kraušanas želeja ir brīvs poliakrilamīda gēls ar lielām porām, kas satur apmēram 7% poliakrilamīda. Šīs poras nedarbojas kā ievērojams šķērslis lielām olbaltumvielu molekulām. Tādējādi šis gēls nedaudz ietekmē šo olbaltumvielu mobilitāti. Tas ļauj atdalīt atbilstoši olbaltumvielu mobilitātei un lielumam, koncentrējot tos starp diviem gēliem.

01. attēls: SDS-PAGE akrilamīda gēls

Kraušanas želejas pH ir 6,8. Tā pH ir skābs nekā tā, kas šķīst želeju par 2 pH vienībām. Šis pH nozīmē zemāku jonu stiprību, līdz ar to lielāku elektrisko pretestību. Tas provocē olbaltumvielu kustīgumu nekā citas lādētas daļiņas, kas atrodas gēlā.

Kas ir atdalīšanas želeja?

SDS-PAGEtehnikas atdalīšanas želeja vai izšķīdinošā želeja ir ļoti koncentrēts poliakrilamīda gēls, kas tiek novietots zemas koncentrācijas kraušanas želejas augšpusē. Atdalīšanas želeja satur lielu daudzumu poliakrilamīda (10%). Šī gēla pH tiek uzturēts kā pH = 8,8, kas ir augstāks pH līmenis nekā kraušanas želejā.

02. Attēls. Gēla elektroforēzes aparāts

Kad olbaltumvielu molekulas sasniedz atdalīšanas želeju, šo molekulu migrācija tiek palēnināta, jo atdalīšanas gēls ir augstas koncentrācijas gēls ar mazu poru izmēru, kas var darboties kā ievērojams šķērslis olbaltumvielu molekulu kustībai. Tas palēnina iespēju pārējiem olbaltumvielām lēnām migrēt, lai panāktu šauru, koncentrētu joslu starp diviem gēliem.

Kāda ir saistība starp želeju kraušanu un želeju atdalīšanu?

• Vienā un tajā pašā aparātā tiek izmantoti gan kraušanas želeja, gan atdalīšanas želeja.

Kāda ir atšķirība starp želeju kraušanas un atdalīšanas želeju?

Kraušanas želeja vs atdalīšanas želeja
Kraušanas gēls ir mazkoncentrēts poliakrilamīda gēls, kas SDS-PAGE tehnikā tiek novietots koncentrētāka izšķirošā gela (atdalošā gela) virspusē..	SDS-PAGE tehnikas atdalīšanas želeja vai izšķīdinošā želeja ir ļoti koncentrēts poliakrilamīda gēls, kas tiek novietots zemas koncentrācijas kraušanas gela augšpusē..
Izvietojums
Kraušanas želeju novieto uz atdalīšanas (atdalīšanas) želejas.	Atdalīšanas želeju ievieto tvertnes apakšā, ko izmanto gēla elektroforēzei.
Koncentrācija
Kraušanas želejas koncentrācija ir augsta.	Atdalīšanas želejas koncentrācija ir zema.
Poliakrilamīda saturs
Kraušanas želeja satur apmēram 7% poliakrilamīda.	Atdalīšanas želeja satur apmēram 10% poliakrilamīda.
pH
Kraušanas želejas pH ir 6,8.	Atdalīšanas želejas pH ir 8,8.
Poras izmērs
Kraušanas želejā ir lieli poru izmēri.	Atdalīšanas želejā ir mazi poru izmēri.
Izšķirtspēja
Kraušanas želeja nodrošina labāku izšķirtspēju.	Atdalīšanas želeja nodrošina sliktu izšķirtspēju.

Kopsavilkums - Kraušanas želeja vs atdalīšana Želeja

Kraušanas želeja un atdalīšanas želeja ir divu veidu poliakrilamīda želejas, kuras izmanto, lai labāk sadalītu olbaltumvielu molekulas dotajā paraugā. Atšķirība starp kraušanas želeju un atdalošo želeju ir tāda, ka kraušanas želejas pH ir 6,8, savukārt atdalošā gela pH ir 8,8.

Atsauce:

1. “Poliakrilamīda gēla elektroforēze.” Poliakrilamīda želejas elektroforēze (teorija): Molekulārā bioloģijas virtuālā laboratorija II: Biotehnoloģija un biomedicīnas inženierija: Amrita Vishwa Vidyapeetham Virtual Lab. Pieejams šeit  
2. “Kā darbojas SDS-PAGE.” Bitesize Bio, 2018. gada 16. februāris. Pieejams šeit
3. “SDS-PAGE kraušanas gēls - BICH 608 (Polymenis-Pettigrew).” Google vietnes. Pieejams šeit 

Attēla pieklājība:

1.'SDS-PAGE akrilamīda gēls'By Bensaccount angļu valodas Vikipēdijā (CC BY 3.0), izmantojot Commons Wikimedia  
2. Gēla elektroforēzes aparāts. Džefrijs M. Vinocurs - Savs darbs, (CC-BY 2.5), izmantojot Commons Wikimedia