Ir svarīgi iegūt vispārīgas zināšanas par DNS sastāvu un struktūru, lai saprastu atšķirību starp augšupējo un pakārtoto DNS. DNS sastāv no polinukleotīdu ķēdēm. Nukleotīdi ir celtniecības bloki, kas veido polinukleotīdu ķēdes, un katrs nukleotīds ir izgatavots no trim komponentiem: piecu oglekļa cukura, slāpekļa bāzes un fosfāta grupas. Fosfāta grupa un OH grupa ir attiecīgi piesaistīti 5 'pozīcijas oglekļa un 3' pozīcijas oglekļa saturam cukura molekulas nukleotīdā. Nukleotīdus savieno fosfodiestera saites, kas veidojas starp viena nukleotīda 5 'fosfāta grupu un blakus esošā nukleotīda 3' OH grupu. Ja polinukleotīdu ķēdē ir brīva 5 'fosfāta grupa, tai piešķir 5'galu; ja tai ir brīva 3 'OH grupa, to piešķir kā 3' galu. Tāpēc DNS šķiedrām parasti ir 5 'un 3' gali atbilstoši polinukleotīdu ķēžu gala pozīcijām. DNS pastāv arī kā divslāņu forma. Divas šķipsnas ir savstarpēji paralēlas. Tāpēc DNS ir divi virzieni, kas virzās virzienā no 5 'uz 3' un 3 'uz 5'. Augšupējā un pakārtotā DNS tiek atsaukta uz atsauci uz 5 '- 3' mRNS virknes transkripciju un sintēzi. Ja DNS tiek uzskatīta par kodēšanas virknes 5. galu no transkripcijas iniciācijas vietas, tā ir zināma kā augšupējā DNS. Ja DNS tiek uzskatīta par 3 'galu virzienā no kodēšanas virknes no transkripcijas iniciācijas vietas, to sauc par pakārtotu DNS. Šī ir galvenā atšķirība starp augšupējo un pakārtoto DNS.
SATURS
1. Pārskats un galvenās atšķirības
2. Kas ir augšupējā DNS
3. Kas ir pakārtotā DNS
4. Salīdzinājums blakus - augšupvērsts un pakārtots DNS
5. Kopsavilkums
Gēns ir struktūras un funkcionālās vienības iedzimtība, kas atrodas uz organisma DNS. Tas tiek glabāts kopā ar norādījumiem olbaltumvielu konstruēšanai. Gēnam ir noteikts DNS molekulas reģions. Ja nepieciešams, tas pārraksta un pārveido olbaltumvielās, sintēzējot mRNS virkni. Parasti gēna kodējošā virkne virzās no 5 'līdz 3' virzienā. Kad tas tiek transkribēts, tas iegūst mRNS virkni tajā pašā virzienā no 5 'līdz 3'. Transkripcijas laikā kā matricas virkne tiek izmantota 3 'līdz 5' antisensse virkne, kas sāk mRNS sintēzi. Gēnā ir transkripcijas iniciācijas vieta. Atsaucoties uz transkripcijas iniciācijas vietu, DNS reģions, kas atrodas kodēšanas virknes 5 'galā, ir pazīstams kā augšupējā DNS. Gēna veicinātājs parasti atrodas DNS augšējā reģionā. Eukariotu gēnos ir TATA kastes, proksimālo prožektoru elementi un pastiprinātāji apgabalā augšpus gēna. Gēna augšpusē esošo reģionu apzīmē ar negatīviem skaitļiem. Gēna augšupējā DNS ir ārkārtīgi svarīga transkripcijai.
Transkripcijas iniciācijas vieta ir pazīstama kā gēna +1 punkts. DNS reģionu no +1 punkta uz kodējošās virknes 3 'galu sauc par pakārtotu DNS. Citiem vārdiem sakot, lejpus gēna atrodas no transkripcijas iniciācijas vietas virzienā uz matricas virknes 5 'galu. Tāpēc gēna reģiona pakārtotajā DNS ietilpst transkripcijas vienība un citas sekvences, piemēram, terminatora secība. Promocents var ietekmēt gēna pakārtoto secību. Gēna pakārtotajai daļai tiek norādīts pozitīvs skaitlis. Gēna pakārtotā DNS ir faktiskais reģions, kas dod olbaltumvielu produktu.
01. attēls. Augšupējā un pakārtotā DNS
Augšup pret DNS | |
DNS reģions kodēšanas sekvences 5 'galā no transkripcijas iniciācijas vietas ir pazīstams kā augšupējā DNS. | DNS reģions kodēšanas virknes 3 'galā no transkripcijas iniciācijas vietas ir pazīstams kā pakārtots DNS. |
Elementi | |
Promoratori un pastiprinātāji atrodas augšupējā DNS | Transkripcijas vienība un terminatora sekvences atrodas pakārtotajā DNS. |
Numerācija | |
Nukleotīdi augšējā reģionā tiek apzīmēti ar negatīvu skaitli | Nukleotīdi tiek apzīmēti ar pozitīvu skaitli. |
Funkcija | |
Šajā reģionā ir elementi, kas nepieciešami, lai regulētu un sāktu transkripciju | Šajā reģionā ir norādījumi olbaltumvielu ražošanai un transkripcijas pārtraukšanai |
RNS virziena augšpus un lejpus ir viegli identificēt. Runājot par atsauces vietu, RNS virknes 5 'gala reģions ir pazīstams kā RNA augšpusē, turpretī reģions virzienā uz 3' galu ir pazīstams kā RNA lejpus. Tomēr DNS ir divi virzieni, kas virzās abos virzienos no 5 'uz 3' un 3 'uz 5'. Tādējādi atšķirība starp augšupējo un pakārtoto DNS ir sarežģīta. Tāpēc tas tiek diferencēts, atsaucoties uz gēna transkripciju. Sākot no transkripcijas iniciācijas vietas uz sensora virknes 5 galu, DNS reģions ir pazīstams kā augšupējā DNS, turpretī no transkripcijas iniciācijas vietas virzienā uz sensora virknes 3 'galu ir pazīstams kā pakārtots DNS. Šī ir atšķirība starp DNS augšupējo un pakārtoto.
Atsauces:
1. Rhee, Amy C., Benjamin H. Somerlot, Neeta Parimi un Jonatha M. Gott. “Atšķirīgas lomas sekvencēm augšpus un lejpus Physarumediting vietām.” RNS. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2009. gada septembris. Tīmeklis. 2017. gada 18. marts
Attēla pieklājība:
1. Barbosa, Cristina, Isabel Peixeiro un Luísa Romão. “Gēnu ekspresijas regulēšana, izmantojot augšējās augšējās atvērtās lasīšanas ietvarus un cilvēku slimības.” PLOS ģenētika. Zinātnes publiskā bibliotēka, n.d. Web. 2017. gada 18. marts.