Atšķirība starp YAC un M13 fāgu vektoru

Galvenā atšķirība - YAC vs M13 Phage Vector
 

DNS klonēšana ir svarīgs process, kas ļauj izplatīt svarīgus organismu DNS fragmentus. Lai izveidotu rekombinanto DNS, kas pārveidojas par saimniekorganismu, nepieciešama īpaša DNS pievienošana vektoru DNS. Vektors ir DNS molekula, kas darbojas kā nesējs, kas svešu ģenētisko materiālu pārnēsā citā šūnā vai organismā. Tam vajadzētu būt spējīgam replicēties saimnieka organismā un radīt vairākas rekombinantās DNS kopijas. DNS klonēšanā tiek izmantoti dažādi vektori. Starp tiem ir divu veidu rauga mākslīgā hromosoma (YAC) un M13 fāgu vektors. Galvenā atšķirība starp YAC un M13 fāgu vektoru ir tā YAC ir mākslīga hromosoma, kas replicējas rauga šūnās kamēr M13 fāgu vektors ir M13 bakteriofāga vienrindu apļveida DNS, kas replicējas E Coli šūnas.

SATURS
1. Pārskats un galvenās atšķirības
2. Kas ir YAC?
3. Kas ir M13 fāgu vektors
4. Salīdzinājums blakus - YAC vs M13 Phage Vector
5. Kopsavilkums

Kas ir YAC vektors?

YAC ir mākslīgi veidota hromosoma, kurai ir spēja nēsāt lielu svešu DNS segmentu un replicēties rauga šūnās. Tam ir centromērs, telomērs un autonomi replicējošas sekvences, kas ir svarīgas replikācijai un stabilitātei. YAC vajadzētu būt arī ar selektīvu marķieri vai marķieriem un restrikcijas vietām, lai tas būtu efektīvs klonēšanas vektors. Lielas sekvences no 1000 kb līdz 2000 kb var ievietot YAC un pārnest uz raugu.

01. attēls: YAC vektors

Kas ir M13 fāgu vektors?

Bakteriofāgs M13 ir vīruss, kas inficē un replicējas tajos E Coli. M13 bakteriofāga genoms ir maza izmēra, apmēram 6,7 kb. Tā ir vienpavediena, apļveida un pozitīvās maņas DNS. Šis vīruss īpaši inficējas E Coli baktērijas caur F pilu. Kad tas iekļūst ssDNS baktērijā, tas sintezē tās komplementa virkni un kļūst par dsDNA vai M13 replicējošo formu (RF). RF saimnieka organismā var izturēties kā ar plazmīdu. DsDNA atkārtojas E Coli un ražo ssDNA, kas satur jaunus fāgus. Šie jaunie fāgi tiek nepārtraukti atbrīvoti no E Coli nenogalinot saimnieka šūnu. Tomēr infekcija palēnina E Coli augšanu. dsDNS var iegūt no baktēriju šūnām un izmantot kā vektorus DNS klonēšanā. Tos sauc par M13 fāgu vektoriem. Tos var viegli manipulēt un izmantot līdzīgi plazmīdu vektoriem.

Šo M13 fāgu raksturīgā inficēšanās spēja kalpo kā laba kvalifikācija, lai tos izmantotu kā vektoru gēnu klonēšanā. Izstrādājot M13 par vektoru, tā genomā jāiekļauj vairāki elementi. Tie ir lac represora (lac I) olbaltumvielu gēns, operatora proksimālais reģions lac Z gēns, lac veicinātājs un daudzkārtēja klonēšanas vieta (polilinksters). Ja par vektoriem izmanto M13 dsDNS, to var uzskatīt par plazmīdu vektoru. Tomēr ssDNA M13 izmantošanai ir priekšrocības DNS sekvencēšanā un vietnei adresētā mutaģenēzē.

Tā kā M13 fāgu vektoram ir vairākas klonēšanas vietas lacZ reģionā rekombinētos vektorus var viegli identificēt ar zilā / baltā kolonijas skrīningu agara plāksnēs, kas satur IPTG un X-Gal. Zilās plāksnes, kas radušās uz plāksnēm, nesatur rekombinētos fagus. Tāpēc klonēšanas nolūkā var izvēlēties fāgus ar ieliktņiem.

02 attēls: bakteriofāgs M13

Kāda ir atšķirība starp YAC un M13 Phage Vector?

YAC vs M13 fāgu vektors
YAC ir ģenētiski modificēta hromosoma, kurai piemīt spēja nēsāt lielu svešas DNS segmentu un replicēties rauga šūnās.	M13 fāgu vektors ir vīrusu vektors, kuru izstrādājusi bakteriofāga M13 un ko izmanto svešas DNS ievietošanai E Coli.
Mērķis
YAC tika izstrādāti lielu genoma DNS fragmentu klonēšanai raugā.	M13 fāgu vektori tiek izmantoti svešas DNS ievietošanai E Coli.
Ievietot garumu
YAC var saturēt megabāzes lieluma genoma ieliktņus (1000 kb - 2000 kb).	Ieliktņu izmērs ir apmēram 1500 bps.
Būvniecība
YAC DNS ir grūti attīrīt neskartu, un YAC vektoru sistēmas izveidošanai nepieciešama augsta koncentrācija.	Tas notiek caur ciklisku fotosintēzes elektronu ķēdi.
Stabilitāte
YAC ir nestabila.	M13 fāgus var viegli iegūt.
Izmērs
Fermenti ir lielākas molekulas.	M13 fāgi ir stabili nekā YAC.

Kopsavilkums - YAC vs M13 Phage Vector

YAC ir mākslīgi veidota vektoru sistēma, kas izmanto noteiktu rauga hromosomas reģionu, lai rauga šūnās ievietotu lielus ģenētiskā materiāla segmentus. M13 fāgu vektors ir vektoru sistēma, kas iegūta no bakteriofāga M 13, kurā tiek izmantots E coli kā saimniekorganisms. Šī ir galvenā atšķirība starp YAC un M13 Phage Vector. Abas ir vienlīdz noderīgas rekombinantās DNS tehnoloģijā un gēnu klonēšanā.

Atsauce:
1. “Vektors”. Ģenētiskās piezīmes - vektors. N.p., n.d. Web. 2017. gada 16. maijs. Https://genetics-notes.wikispaces.com/Vector
2. “Rauga mākslīgā hromosoma.” Wikipedia. Wikimedia Foundation, 2017. gada 21. aprīlis. Web. 2017. gada 16. maijs. .

Attēla pieklājība:
1. J3D3 “M13B” - pašu darbs (CC BY-SA 3.0), izmantojot Commons Wikimedia