Pagātnē, Archaea tika klasificēti kā baktērijas un sauca arhebaktērijas. Bet tika atklāts, ka archaea ir atšķirīga evolūcijas vēsture un bioķīmija, salīdzinot ar
Līdz 20. gadsimta vidum biologi visas dzīvās lietas klasificēja kā augu vai dzīvnieku. Bet šī sistēma nespēja uzņemt sēnītes, protistus un baktērijas. Tātad līdz 70. gadiem klasifikācijas sistēma attīstījās līdz tā dēvētajai Piecām karaļvalstīm - prokariotiem (baktērijām) un eikariotiem (augiem, dzīvniekiem, sēnītēm, protistiem). Eikariotiem ir raksturīga kodolu, citoskeletu un iekšējo membrānu klātbūtne viņu šūnās.
70. gadu beigās doktors Karls Voiss un viņa kolēģi Ilinoisas universitātē identificēja mikroorganismu grupu, kuru ģenētiskais sastāvs ievērojami atšķīrās no citām baktērijām. Tātad viņi sadalīja prokariotu dzīvi tajā, ko sauca arhaeabaktērijas un eubakterijas. Tomēr viņi vēlāk secināja, ka "arhaeabacteria" bija pietiekami atšķirīgas, lai tās vispār nebūtu baktērijas. Tātad grupas tika pārdēvētas par Archaea un baktērijas.
Dzīvības koks, kurā parādīta visu dzīvo organismu klasifikācija.Gan arhaea, gan eubacteria ir līdzīgas pēc formas un lieluma. Tie abi ir sastopami kā stieņi, kokči, spirāles, plāksnes vai satīti.
Archaea un baktēriju vispārējā šūnu struktūra ir vienāda, bet dažu struktūru sastāvs un organizācija archaea atšķiras. Līdzīgi kā baktērijām, archaea nav iekšējo membrānu, bet abām ir šūnas siena un peldēšanai tiek izmantota flagella.
Archaea atšķiras ar to, ka viņu šūnu sienā nav peptidoglikāna un šūnu membrānā tiek izmantoti ar ēteri saistīti lipīdi pretstatā ar esteriem saistītiem lipīdiem baktērijās.
Archaea flagella attīstījās no IV tipa baktēriju pili, savukārt baktēriju flagella attīstījās no III tipa sekrēcijas sistēmas. Baktēriju flagellum ir kā dobs kātiņš, ko veido apakšvienības, kuras var brīvi kustēties pa centrālo poru, pievienojot flagellas galu, kamēr archaea flagella subvienības tiek pievienotas pamatnei.
Archaea reproducēt aseksuāli bināras dalīšanās, pumpuru veidošanās un sadrumstalotības procesā. Eubakterijas reproducēt aseksuāli, izmantojot bināru dalīšanos, pumpuru veidošanos, sadrumstalotību, bet eubakterijām ir unikāla spēja veidot sporas, lai tās gadiem ilgi nedarbotos - šī īpašība nav raksturīga Archaea. Baktēriju augšana notiek trijās fāzēs: kavēšanās fāze, kad šūnas pielāgojas jaunai videi, log fāze apzīmē eksponenciālu augšanu un stacionāra fāze, kad barības vielas tiek iztērētas..
Archaea var izdzīvot ekstremālā un skarbā vidē, piemēram, karstajos avotos, sāls ezeros, purvos, okeānos, atgremotāju un cilvēku zarnās. Eubakterijas ir visuresošas un atrodamas augsnē, karstos avotos, radioaktīvos notekūdeņos, zemes garozā, organiskajās vielās, augu un dzīvnieku ķermeņos utt..