SDS PAGE vs gela elektroforēze
Elektroforēzi var izmantot, lai noskaidrotu objekta masu parasti olbaltumvielu un dezoksiribonukleīnskābes (DNS) noteikšanai. DNS virkne, nonākot ķīmiskās vielās, var paātrināt vai palēnināt informācijas procesu. DNS marķieri ar zināmu masu tiek izmantoti, lai tuvinātu to objektu lielumu, kas pārvietojas, kad elektroforēze ir beigusies. Elektroforēze, visticamāk, ir molekulāro biologu un bioķīmiķu visbiežāk izmantotais līdzeklis.
Šajā procesā parasti izmanto divu veidu elektroforēzi. Tās ir nātrija dodecilsulfāta poliakrilamīda gēla elektroforēze (SDS-PAGE) un dabiskā gēla elektroforēze.
SDS-PAGE ir neselektīva gēla elektroforēzes metode, ko izmanto tādās jomās kā: bioķīmija, kriminālistika, bioloģija un ģenētika, lai atdalītu olbaltumvielas no to elektroforētiskās mobilitātes. SDS ir anjonu virsmaktīvā viela, ko var izmantot, lai palīdzētu šūnu lizēšanā DNS ekstrakcijas laikā un olbaltumvielu atdalīšanai SDS-PAGE. Elektroforēzes laikā olbaltumvielu maisījumu vispirms sašķidrina SDS šķīdumā. Pēc tam tiek pielietota viela, ko sauc par Merkaptoeetanolu, lai noņemtu disulfīdu saites, lai olbaltumvielas būtu lineāras. Pēc tam tiek sākta elektroforēze. Rezultāti iegūtu divus molekulu atlikumus, no kuriem viens ir SDS-PAGE.
SDS-PAGE neesamība nav problēma, jo gēla elektroforēzi joprojām var veikt tikai tad, ja olbaltumvielas nezaudē visu savu sekundāro un terciāro struktūru un neatveras parasti taisnos stieņos..
Tikmēr vietējā gēla elektroforēzē gēlu izmanto kā antikonvektīvu barotni. Parasti to izmanto bioloģisko makromolekulu, piemēram, DNS, ribonukleīnskābes (RNS) un olbaltumvielu atdalīšanai. To var izmantot arī nanodaļiņu atdalīšanai.
Vietējā gēla elektroforēzē tiek izmantoti divi galvenie gēli, proti:
Agarozes želeja, ko izmanto lielākām molekulām. Šis gēls neidentificē nelielas atšķirības starp divām molekulārajām joslām. To izmanto tikai un vienīgi DNS atdalīšanai. Agarozes gela vizualizācija tiek veikta ar etiīdija bromīda sajaukumu.
Poliakrilamīda gēls, ko izmanto mazākām molekulām. Šis gēls identificē atšķirības starp molekulārajām joslām. Papildus DNS, tas var arī atdalīt olbaltumvielas.
Kopsavilkums:
1.SDS-PAGE ir neselektīva gēla elektroforēzes metode, ko izmanto tādās jomās kā: bioķīmija, kriminālistika, bioloģija un ģenētika, lai atdalītu olbaltumvielas no to elektroforētiskās mobilitātes, savukārt gēla elektroforēzi parasti izmanto bioloģisko makromolekuļu, piemēram, DNS, atdalīšanai. ribonukleīnskābe (RNS) un olbaltumvielas. To var izmantot arī nanodaļiņu atdalīšanai.
2.Dative gela elektroforēze ir divu veidu, proti: agarozes gels un poliakrilamīda gēls.