Atšķirība starp Transposon un Retrotransposon

Transposons vs Retrotransposons

Transposoni un retrotransposoni ir DNS ģenētiski komponenti, un starp tiem pastāv lielas atšķirības. Šo ģenētisko materiālu klātbūtnes procentuālais daudzums dažādās sugās ir atšķirīgs, un to funkcijas nosaka organisma likteņus ar mutācijām un citām fenotipiski nozīmīgām izmaiņām. Transposoni un retrotransposoni ir gēni vai noteiktu gēnu kolekcijas, kas atrodas DNS virzienos, un šo vietu galvenie cēloņi ir to atrašanās vietas izmaiņas. Tomēr šajā rakstā ir paredzēts īsi apspriest šo gēnu funkcijas un sniegts transposonu un retrotransposonu salīdzinājums.

Kas ir Transposon??

Transposoni ir interesanti DNS fragmenti vai segmenti ar spēju mainīt DNS virknes atrašanās vietu griezuma un ielīmēšanas mehānisma formā. Šī transposonu mobilā rakstura dēļ tos sauc par lēkājošajiem gēniem. Transposoni ir divi galvenie veidi, kas pazīstami kā I klases transposoni un II klases transposoni. Parasti II klases tips tiek saukts par transposonu un I klases tips - par retrotransposonu. Mobilo DNS segmentu sagriešanas un ielīmēšanas procesus regulē fermenta transpozāze. Ferments saistās ar abiem transposona galiem un sagriež DNS virknes fosfodiesteru saites, izolē transposonu, pārvieto to uz mērķa vietu un saistās jaunajā vietā. Tomēr šo procesu ir interesanti saprast, jo daži transposoni var pārvietoties uz noteiktām vietām tikai tāpēc, ka bāzes secības nav savienojamas ar mērķa vietu. Gēniem ar vienas virknes vienu galu ir tāda pati bāzes secība kā ar otras vienas virknes otru galu ir transposoni ar lipīgām malām, jo ​​tie var saistīties ar mērķa DNS virknes vietām ar tādu pašu bāzes secību kā lipīgajos galos. . Tomēr šī gēnu mobilitāte var izraisīt izmaiņas gan genotipā, gan arī organisma fenotipā. Pēc tam tika darīti pieejami zinātnieki, kas izgudroja transpozonus, kā arī ģenētiski modificētu pārtiku un organismus atbilstoši vēlamajiem pielāgojumiem. Augsti produktīvi lauksaimniecības augi, antibiotikas ar ārstnieciskām īpašībām, mājlopi bija daži no izdevīgi izstrādātajiem produktiem pēc tam, kad 1940. gados Barbara Maklintoka izgudroja transposonus..

Kas ir Retrotransposon?

Retrotransposoni ir I klases transposoni, un tie pārvietojas pa genomu, izmantojot kopēšanas un ielīmēšanas mehānismu. Retrotransposonu mobilitātes mehānisms ietver dažus lielus posmus, piemēram, DNS virknes gēna segmenta kopēšanu RNS, RNS kopijas pārvietošanu uz mērķa vietu, RNS secības transkripciju atpakaļ uz DNS, izmantojot reverso transkriptāzi, un ievietošanu gēna jaunā genoma DNS virknes atrašanās vietā. Šo retrotransposonu abiem galiem parasti ir gari terminālu atkārtojumi ar apmēram 1000 bāzes pāriem, un tos izmanto kā šo gēnu identifikācijas pazīmes. Šie gēni tiek viegli pastiprināti genoma iekšienē, un retrotransposonu procentuālais daudzums cilvēka genomā ir aptuveni 50%. Tie varētu būt diezgan bīstami, jo izraisošajam AIDS, HIV un T-šūnu leikēmijas vīrusam ir retrotransposoni to RNS genomos. Faktiski šie vīrusi var saistīt retrotransposonus jebkurā cilvēka DNS virknes vietā, izmantojot reverso transkriptāzi un integrāzi. Integrētās enzīms darbojas tāpat kā transposāze II klases transposonos.